R语言ADAPTS包说明文档（版本 1.0.6）

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AugmentSigMatrix 生成一个扩充的签名矩阵
buildSeed 建立反卷积种子矩阵，添加比例选项
buildSpilloverMat 建立溢出矩阵
calcAcc 计算预测精度
clustWspillOver 具有溢出的集群
collapseCellTypes 塌陷单元类型
estCellCounts.nPass n通溢出矩阵的反褶积
estCellPercent 反褶积方法的包装器
estCellPercent.DCQ DCQ反褶积
estCellPercent.DeconRNASeq 反褶积
estCellPercent.nnls 非负最小二乘反褶积
estCellPercent.proportionsInAdmixture 比例反褶积
estCellPercent.spillOver 从溢出估计单元百分比
estCellPercent.svmdecon SVMDECON反褶积
findConvergenceIter 找出结果在哪个迭代收敛，即平均结果是稳定的。
getF1mcc 获取f1/mcc
getLM22cells LM22查找表
gListFromRF 使用随机林创建一个gList
hierarchicalClassify 分层反褶积
hierarchicalSplit 建立层次细胞群。
Licenses Celgene legal要求的许可证
LM22 白细胞22数据矩阵
loadMGSM27 加载MGSM27
loadModMap LM22至xCell LUT
loopTillConvergence 循环测试矩阵直到收敛
meanResults 多次迭代结果的meta分析
MGSM27 骨髓瘤基因组特征矩阵27
missForest.par 使用平行missForest来插补缺失值。
plotKappas 绘图条件编号
rankByT 对每种细胞类型的基因进行排序
remakeLM22p 生成一个扩充的签名矩阵
scSample 根据cellIDs构建groupSize池
shrinkByKappa 计算签名子集的条件数
shrinkSigMatrix 收缩签名矩阵
spillToConvergence 溢出到收敛
splitSCdata 将单个单元格数据集拆分为多个集合
SVMDECON 支持向量机反褶积
testAllSigMatrices 一次生成所有签名矩阵，并选择去掉一半数据作为测试集
weightNorm svmdecov助手函数