R语言ASMap包说明文档(版本 1.0-4)

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ASMap-package 连锁图谱构建和R/qtl对象操作的附加功能。
alignCross 图形连杆组标识和对齐。
breakCross qtl交叉对象的断链群
combineMap 组合来自多个“qtl”交叉对象的连锁图谱
fixClones 克隆基因型群的一致基因型
genClones 查找和报告基因型克隆
heatMap 估计成对重组分数的热图和标记间的LOD连锁。
mapBC 大麦回交群体连锁图谱的构建
mapBCu 回交大麦群体的未构建标记集
mapDH 双单倍体小麦群体连锁图谱的构建
mapDHf 双单倍体小麦群体的未构建标记集
mapF2 自交F2大麦群体连锁图谱的模拟构建
mergeCross “qtl”交叉对象的合并连锁群
mstmap 利用MSTmap快速构建qtl连锁图谱。
mstmap.cross 利用MSTmap快速构建qtl连锁图谱。
mstmap.data.frame 使用MSTmap为数据帧对象构建非常快速的链接图。
pp.init 参数初始化功能
profileGen R/qtl杂交对象的个体基因型分布统计
profileMark R/qtl杂交对象的个体标记和区间统计分析
pullCross 从连锁图中提取标记。
pushCross 将标记推入已建立的R/qtl连锁图谱。
pValue P值图
quickEst 遗传图谱距离的快速估计。
statGen R/qtl杂交对象的个体基因型统计
statMark R/qtl杂交对象的个体标记和区间统计
subsetCross R/qtl对象子集