R语言AnalyzeFMRI包说明文档(版本 1.1-21)
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analyze2nifti
从分析文件创建NIFTI文件
centering
对中
cluster.threshold
数组的群集阈值。
cluster_mass
数组的群集阈值。
cov.est
估计相邻体素之间的协方差
covariance_est
估计相邻体素之间的协方差
diminfo2fps
小信息2fps
EC.3D
三维随机场的期望欧拉特征
eigenvalues
特征值
f.analyze.file.summary
打印.img文件内容摘要
f.analyzeFMRI.gui
启动分析功能磁共振图形用户界面
f.basic.hdr.list.create
以ANALYZE格式创建basic.hdr列表
f.basic.hdr.nifti.list.create
以NIFTI格式创建basic.hdr列表
f.complete.hdr.nifti.list.create
以NIFTI格式创建完整的.hdr列表
f.ica.fmri
将空间ICA(独立分量分析)应用于fMRI数据集
f.ica.fmri.gui
tcltkgui将ICA应用于fMRI数据集
f.icast.fmri
将空间或时间ICA(独立分量分析)应用于fMRI-NIFTI数据集
f.icast.fmri.gui
tcltkgui将空间或时间ICA应用于fMRI-NIFTI数据集
f.nifti.file.summary
打印.img文件内容摘要
f.plot.ica.fmri
从f的输出绘制指定的组件。功能磁共振成像
f.plot.ica.fmri.jpg
绘制f的输出分量。功能磁共振成像到一系列jpeg文件
f.plot.volume.gui
tcltk图形用户界面显示功能磁共振成像或磁共振成像图像
f.read.analyze.header
读取分析头文件
f.read.analyze.slice
从.img文件中读取一个切片
f.read.analyze.slice.at.all.timepoints
从.img文件的所有时间点读取切片
f.read.analyze.tpt
在一个时间点读入一卷
f.read.analyze.ts
读入一个体素时间序列
f.read.analyze.volume
读取整个.img文件
f.read.header
读取或分析NIFTI头文件
f.read.nifti.header
读取Nifti头文件
f.read.nifti.slice
以NIFTI格式从.img或.nii文件中读取一个切片
f.read.nifti.slice.at.all.timepoints
从NIFTI.img或.nii文件的所有时间点读取切片
f.read.nifti.tpt
在一个时间点读入一卷
f.read.nifti.ts
读入一个体素时间序列
f.read.nifti.volume
读取整个图像文件
f.read.volume
读取整个图像文件
f.spectral.summary
绘制fMRI数据集光谱特性的图形摘要
f.spectral.summary.nifti
绘制fMRI数据集光谱特性的图形摘要
f.write.analyze
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
f.write.array.to.img.2bytes
写入2字节整数数组
f.write.array.to.img.8bit
写入1字节整数数组
f.write.array.to.img.float
写入4字节浮点数组
f.write.list.to.hdr
以ANALYZE格式写入.hdr文件
f.write.list.to.hdr.nifti
以NITI格式写入.hdr文件
f.write.nifti
将数组写入NIFTI格式的.img/.hdr对或.nii文件
f.write.nii.array.to.img.2bytes
写入2字节整数数组,并在文件开头添加NIFTI头部分
f.write.nii.array.to.img.8bit
写入1字节整数数组,并在文件开头添加NIFTI头部分
f.write.nii.array.to.img.float
写入4字节浮点数组,并在文件开头添加NIFTI头部分
fourDto2D
四至二维
fps2diminfo
fps2diminfo文件
gaussfilter1
计算离散高斯平滑核。
gaussfilter2
计算离散高斯平滑核。
GaussSmoothArray
具有高斯核的空间光滑阵列。
GaussSmoothKernel
计算离散高斯平滑核。
ICAspat
伊卡斯帕
ICAtemp
伊卡坦普
ica_fmri_JM
伊卡斯帕
ijk2xyz
ijk2xyz公司
magicfield
从图像文件的头部获取magicfield
mat34.to.TRSZ
仿射4x4(或3x4)矩阵以平移、旋转、剪切和缩放
mat34.to.TZSR
仿射4x4(或3x4)矩阵以平移、缩放、剪切和旋转
model.2.cov.func
从Hartvig模型2计算协方差
model.2.est.gamma
Hartvig和Jensen(2000)模型2的伽马估计
N2G
适合N2G型号
N2G.Class.Probability
N2G模型的后验概率
N2G.Density
计算N2G模型的密度函数
N2G.Fit
N2G模型的优化函数
N2G.Inverse
将N2G模型的参数变换回它们的实域
N2G.Likelihood
计算N2G模型的(负)可能性
N2G.Likelihood.Ratio
N2G似然比
N2G.Region
N2G正态分量间隔
N2G.Spatial.Mixture
fMRI空间混合建模
N2G.Transform
变换N2G模型的参数,使其位于实线上。
nifti.quatern.to.mat44
四元数(等…)到仿射4x4矩阵
NonLinearSmoothArray
三维和四维阵列的非线性空间定位。
non_lin_gauss_smooth
三维和四维阵列的非线性空间定位。
orientation
定向存储器
Q2R
四元数到旋转
R2Q
旋转到四元数
read2byte_v1_JM
读取整个.img文件
read4byte_v1_JM
读取整个.img文件
readchar_v1_JM
读取整个.img文件
readdouble_v1_JM
读取整个.img文件
readfloat_v1_JM
读取整个.img文件
read_analyze_header_wrap_JM
读取整个.img文件
read_nifti_header_wrap_JM
读取Nifti头文件
read_nifti_magic_wrap
读取Nifti头文件
reduction
减少
Sim.3D.GammaRF
模拟伽马分布随机场
Sim.3D.GRF
模拟GRF
sim_grf
模拟GRF
SmoothEst
高斯随机场方差协方差矩阵的估计
spatial_mixture
fMRI空间混合建模
st2xyzt
st2xyzt公司
swaptest_wrap_JM
读取整个.img文件
temporal_non_lin_gauss_smooth
三维和四维阵列的非线性空间定位。
threeDto4D
三维到四维
Threshold.Bonferroni
计算Bonferroni阈值
Threshold.FDR
错误发现率(FDR)阈值
Threshold.RF
随机场理论。
twoDto4D
2到4D
write2byteappend_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write2byte_JM
读取整个.img文件
write8bitappend_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write8bit_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
writefloatappend_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
writefloat_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write_analyze_header_wrap_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write_nifti_header_wrap_JM
以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
xyz2ijk
xyz2ijk公司
xyzt2st
xyzt2st型