R语言BICORN包说明文档(版本 0.1.0)

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A TF基因调控强度矩阵
alpha 逆伽马分布超参数α
A_old 前一轮TF基因调控强度矩阵
A_sampling 调节强度采样功能
baseline_sampling 基因基线表达采样函数
base_line 基因基线表达
base_line_old 上一轮的基因基线表达样本。
beta 反伽马分布超参数β
BICORN BICORN算法函数
Binding_genes 优先结合网络中的基因
Binding_matrix 前TF基因结合网络
Binding_TFs 先前绑定网络中的TFs
C TF基因结合网络
C_old 上一轮抽检的TF基因结合网络
C_prior 前TF基因结合网络
C_sampling_cluster cis调节模块采样功能
data_integration BICORN的数据初始化
Exp_data 基因表达数据
Exp_genes 表达数据中的基因
sigmanoise_sampling 拟合残差方差抽样函数
sigma_A 调节强度方差
sigma_baseline 基线基因表达的变异。
sigma_noise 基因表达拟合残差方差。
sigma_X 转录因子活性变异
X 转录因子活性矩阵
X_old 转录因子活性矩阵从上一轮抽样
X_sampling 转录因子活性采样函数
Y 用于模块推理的基因表达数据