A | TF基因调控强度矩阵 | ||
alpha | 逆伽马分布超参数α | ||
A_old | 前一轮TF基因调控强度矩阵 | ||
A_sampling | 调节强度采样功能 | ||
baseline_sampling | 基因基线表达采样函数 | ||
base_line | 基因基线表达 | ||
base_line_old | 上一轮的基因基线表达样本。 | ||
beta | 反伽马分布超参数β | ||
BICORN | BICORN算法函数 | ||
Binding_genes | 优先结合网络中的基因 | ||
Binding_matrix | 前TF基因结合网络 | ||
Binding_TFs | 先前绑定网络中的TFs | ||
C | TF基因结合网络 | ||
C_old | 上一轮抽检的TF基因结合网络 | ||
C_prior | 前TF基因结合网络 | ||
C_sampling_cluster | cis调节模块采样功能 | ||
data_integration | BICORN的数据初始化 | ||
Exp_data | 基因表达数据 | ||
Exp_genes | 表达数据中的基因 | ||
sigmanoise_sampling | 拟合残差方差抽样函数 | ||
sigma_A | 调节强度方差 | ||
sigma_baseline | 基线基因表达的变异。 | ||
sigma_noise | 基因表达拟合残差方差。 | ||
sigma_X | 转录因子活性变异 | ||
X | 转录因子活性矩阵 | ||
X_old | 转录因子活性矩阵从上一轮抽样 | ||
X_sampling | 转录因子活性采样函数 | ||
Y | 用于模块推理的基因表达数据 |