R语言BioInstaller包说明文档(版本 0.3.7)

返回R语言所有包列表

BioInstaller-package 该软件包是一个基于R语言构建交互式、可复制生物数据分析应用程序的新平台,包括R函数和R应用程序restapi。
BioInstaller 该软件包是一个基于R语言构建交互式、可复制生物数据分析应用程序的新平台,包括R函数和R应用程序restapi。
change.info 更新生物软件系统信息
conda 康达的包装函数
conda.env.create “conda env create”的包装函数,基于环境文件创建环境
conda.env.list “conda env list”的包装函数,列出conda环境
conda.list “conda list”的包装函数,列出conda环境中的链接包。
copy_configs 函数复制BioInstaller的默认配置文件
copy_plugins 函数复制BioInstaller的默认插件
crawl.all.versions 一个函数可以用来从非ITHUB.cfg存储的信息
del.info 删除系统生物软件信息
docker.pull 使用docker拉取图像
docker.search BioInstaller docker数据库中的搜索软件docker信息
get.info 显示系统的生物软件信息
get.meta 获取BioInstaller收集的源的元信息,例如数据库、GitHub源、非GitHub源、web源
get.meta.files 获取所有BioInstaller元文件路径,如数据库、GitHub源、非GitHub源、web源
install.bioinfo 下载并安装生物学软件或数据库
install.github 从Github安装或下载软件
install.nongithub 从非Github网站安装或下载软件
is.biosoftwares.db.active 测试活动配置文件
new.bioinfo 在github论坛上创建新的BioInstaller项目
set.biosoftwares.db 将filename_points_covered_by_landmarks设置为安装程序db
set_shiny_workers 函数为后台服务设置工作线程
show.installed 显示系统中安装的所有生物软件
spack spack的包装函数
spack.list “spack list”的包装函数,列出并搜索可用的包
web 函数来运行应用程序服务