R语言BisqueRNA包说明文档(版本 1.0.4)

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CalculateSCCellProportions 基于单细胞数据计算细胞比例
CorTri 关联数据帧的列
CountsToCPM 将表达式集中的计数数据转换为百万计数(CPM)
EstimatePCACellTypeProportions 使用表达式矩阵的第一个PC估计单元类型比例
FilterUnexpressedGenes 删除所有样本中表达为零的表达集中的基因
FilterZeroVarianceGenes 移除样本间零方差表达集中的基因
GenerateSCReference 为单单元数据中标识的单元类型生成引用配置文件
GetCTP 批量返回单元格类型
GetNumGenes 在没有加权信息的情况下获取要使用的基因数
GetNumGenesWeighted 获取用于加权PCA的基因数
GetOverlappingGenes 在单细胞数据、批量数据和标记基因中寻找重叠基因
GetOverlappingSamples 在单单元和批量数据中查找重叠样本
GetUniqueMarkers 仅在1个单元格类型中获取唯一标记
MarkerBasedDecomposition 使用标记基因执行基于标记的批量表达分解
ReferenceBasedDecomposition 使用单单元数据对批量表达式执行基于引用的分解
SemisupervisedTransformBulk 仅使用单细胞数据转换基因的大量表达
SeuratToExpressionSet 将Seurat对象转换为表达式集
SimulateBarcode 分解图模拟条形码
SimulateData 模拟分解说明的数据
SupervisedTransformBulk 转换给定重叠数据的基因的大量表达