CalculateSCCellProportions | 基于单细胞数据计算细胞比例 | ||
CorTri | 关联数据帧的列 | ||
CountsToCPM | 将表达式集中的计数数据转换为百万计数(CPM) | ||
EstimatePCACellTypeProportions | 使用表达式矩阵的第一个PC估计单元类型比例 | ||
FilterUnexpressedGenes | 删除所有样本中表达为零的表达集中的基因 | ||
FilterZeroVarianceGenes | 移除样本间零方差表达集中的基因 | ||
GenerateSCReference | 为单单元数据中标识的单元类型生成引用配置文件 | ||
GetCTP | 批量返回单元格类型 | ||
GetNumGenes | 在没有加权信息的情况下获取要使用的基因数 | ||
GetNumGenesWeighted | 获取用于加权PCA的基因数 | ||
GetOverlappingGenes | 在单细胞数据、批量数据和标记基因中寻找重叠基因 | ||
GetOverlappingSamples | 在单单元和批量数据中查找重叠样本 | ||
GetUniqueMarkers | 仅在1个单元格类型中获取唯一标记 | ||
MarkerBasedDecomposition | 使用标记基因执行基于标记的批量表达分解 | ||
ReferenceBasedDecomposition | 使用单单元数据对批量表达式执行基于引用的分解 | ||
SemisupervisedTransformBulk | 仅使用单细胞数据转换基因的大量表达 | ||
SeuratToExpressionSet | 将Seurat对象转换为表达式集 | ||
SimulateBarcode | 分解图模拟条形码 | ||
SimulateData | 模拟分解说明的数据 | ||
SupervisedTransformBulk | 转换给定重叠数据的基因的大量表达 |