| calc_mappability | 用于计算每个样本的可映射性的函数。 | ||
| Evers_CRISPRn_RT112 | 基准CRISPRn汇集了来自Evers等人的屏幕数据。 | ||
| fit_ab | 一个C++函数，用于为sgRNA水平测试执行参数估计。它将估计两个不同的参数‘phat’和‘vhat’，我们假设输入计数数据遵循β二项分布。Keith Baggerly博士最初在Matlab中实现了这段代码，为了提高速度，已经用C++重写了这段代码。 | ||
| get_CPM | 用于规范sgRNA读取计数的函数。 | ||
| join_count_and_design | 连接计数表和设计表的函数。 | ||
| measure_gene_stats | 使用sgRNA水平统计量执行基因水平测试的函数。 | ||
| measure_sgrna_stats | 在sgRNA水平上执行统计检验的函数 | ||
| plot_corr_heatmap | 显示NGS样本的热图sgRNA水平相关性的函数。 | ||
| plot_count_distribution | 绘制读取计数分布的函数。 | ||
| plot_dotplot | 显示基因点图的功能。 | ||
| plot_PCA | 绘制样本前两个主成分的函数。 | ||
| quant | 一个C++函数，用于量化NGS样本中的sgRNA丰度。 | ||
| run_estimation | 在sgRNA级别执行统计测试的函数，已弃用。 | ||
| run_sgrna_quant | 从NGS样本运行sgRNA定量算法的函数 | ||
| Sanson_CRISPRn_A375 | 基准CRISPRn汇集了Sanson等人的屏幕数据。 |