CHNOSZ-package | 地球化学热力学计算与图解 | ||
aasum | 蛋白质的氨基酸组成 | ||
add.OBIGT | 使用热力学数据库的函数 | ||
add.protein | 蛋白质的氨基酸组成 | ||
affinity | 生成反应的化学亲和力 | ||
AkDi | 状态方程 | ||
allparents | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
aminoacids | 使用序列数据的函数 | ||
as.chemical.formula | 使用化学公式的函数 | ||
axis.label | 表示化学式和性质的函数 | ||
basis | 定义基本种类 | ||
basis.elements | 交换基种 | ||
basis.logact | 交换基种 | ||
berman | 矿物热力学性质 | ||
bgamma | 水相活度系数 | ||
buffer | 计算缓冲化学活度 | ||
calculateDensity | 深部地下水(DEW)模型 | ||
calculateEpsilon | 深部地下水(DEW)模型 | ||
calculateGibbsOfWater | 深部地下水(DEW)模型 | ||
calculateQ | 深部地下水(DEW)模型 | ||
cgl | 状态方程 | ||
check.OBIGT | 热力学数据校验功能 | ||
checkEOS | 热力学数据校验功能 | ||
checkGHS | 热力学数据校验功能 | ||
CHNOSZ | 热力学数据库和系统设置 | ||
convert | 转换单位的函数 | ||
count.aa | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
count.elements | 解析化学式 | ||
Cp_s_var | 水相状态参数的回归方程 | ||
CV | 目标函数 | ||
CVRMSD | 目标函数 | ||
DDGmix | 目标函数 | ||
def2gi | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
demos | 运行文档中的示例 | ||
describe.basis | 表示化学式和性质的函数 | ||
describe.property | 表示化学式和性质的函数 | ||
describe.reaction | 表示化学式和性质的函数 | ||
DEW | 深部地下水(DEW)模型 | ||
DGinf | 目标函数 | ||
DGmix | 目标函数 | ||
DGtr | 目标函数 | ||
diagram | 化学活性图 | ||
dimSums | 用于多维数组的函数 | ||
dPdTtr | 其他任务的功能 | ||
dumpdata | 热力学数据校验功能 | ||
E.units | 转换单位的函数 | ||
element.mu | 交换基种 | ||
entropy | 使用化学公式的函数 | ||
eos | 状态方程 | ||
EOScalc | 水相状态参数的回归方程 | ||
EOScoeffs | 水相状态参数的回归方程 | ||
EOSlab | 水相状态参数的回归方程 | ||
EOSplot | 水相状态参数的回归方程 | ||
EOSregress | 水相状态参数的回归方程 | ||
EOSvar | 水相状态参数的回归方程 | ||
eqdata | 从EQ6输出文件读取数据 | ||
equil.boltzmann | 物种平衡化学活性 | ||
equil.reaction | 物种平衡化学活性 | ||
equilibrate | 物种平衡化学活性 | ||
examples | 运行文档中的示例 | ||
expect_maxdiff | 编写测试的函数 | ||
expr.property | 表示化学式和性质的函数 | ||
expr.species | 表示化学式和性质的函数 | ||
expr.units | 表示化学式和性质的函数 | ||
extdata | 额外数据 | ||
find.tp | 化学活性图 | ||
findit | 优化目标函数的网格搜索 | ||
getnames | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
getnodes | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
getrank | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
GHS | 使用化学公式的函数 | ||
GHS_Tr | 其他任务的功能 | ||
group.formulas | 蛋白质功能(其他计算) | ||
hkf | 状态方程 | ||
i2A | 使用化学公式的函数 | ||
IAPWS95 | IAPWS-95水的性质 | ||
ibasis | 交换基种 | ||
id.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
info | 搜索热力学数据库 | ||
ionize.aa | 蛋白质的电离特性 | ||
label.figure | 创建和修改绘图的函数 | ||
label.plot | 创建和修改绘图的函数 | ||
lex | 用于生成图例文本的函数 | ||
list2array | 用于多维数组的函数 | ||
lNaCl | 用于生成图例文本的函数 | ||
logact | 目标函数 | ||
lP | 用于生成图例文本的函数 | ||
lS | 用于生成图例文本的函数 | ||
lT | 用于生成图例文本的函数 | ||
lTP | 用于生成图例文本的函数 | ||
makeup | 解析化学式 | ||
mash | 多金属系统的组合图 | ||
mass | 使用化学公式的函数 | ||
maxdiff | 编写测试的函数 | ||
mix | 多金属系统的组合图 | ||
mod.buffer | 计算缓冲化学活度 | ||
mod.OBIGT | 使用热力学数据库的函数 | ||
moles | 物种平衡化学活性 | ||
mosaic | 基种变化的化学亲和力 | ||
MP90.cp | 蛋白质功能(其他计算) | ||
mtitle | 创建和修改绘图的函数 | ||
NaCl | 简单氯化钠水溶液 | ||
nonideal | 水相活度系数 | ||
nucleic.complement | 使用序列数据的函数 | ||
nucleic.formula | 使用序列数据的函数 | ||
OBIGT | 热力学数据库和系统设置 | ||
objective | 目标函数 | ||
P.units | 转换单位的函数 | ||
palply | 条件并行处理 | ||
parent | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
pearson | 目标函数 | ||
pinfo | 蛋白质热力学性质综述 | ||
plot_findit | 优化目标函数的网格搜索 | ||
protein.basis | 蛋白质热力学性质综述 | ||
protein.equil | 蛋白质热力学性质综述 | ||
protein.formula | 蛋白质热力学性质综述 | ||
protein.info | 蛋白质热力学性质综述 | ||
protein.length | 蛋白质热力学性质综述 | ||
protein.OBIGT | 蛋白质热力学性质综述 | ||
qqr | 目标函数 | ||
ratlab | 表示化学式和性质的函数 | ||
read.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
read.fasta | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
rebalance | 多金属系统的组合图 | ||
reset | 热力学数据库和系统设置 | ||
retrieve | 按元素检索物种 | ||
revisit | 目标函数的作图与优化 | ||
RH2OBIGT | 热力学数据校验功能 | ||
rho.IAPWS95 | 水和蒸汽性质函数 | ||
richness | 目标函数的作图与优化 | ||
RMSD | 目标函数 | ||
sciname | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
SD | 目标函数 | ||
seq2aa | 蛋白质的氨基酸组成 | ||
shannon | 目标函数 | ||
slice | 用于多维数组的函数 | ||
slice.affinity | 用于多维数组的函数 | ||
solubility | 物种平衡化学活性 | ||
spearman | 目标函数 | ||
species | 感兴趣的物种 | ||
subcrt | 物种和反应的性质 | ||
swap.basis | 交换基种 | ||
syslab | 表示化学式和性质的函数 | ||
T.units | 转换单位的函数 | ||
taxonomy | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
thermo | 热力学数据库和系统设置 | ||
thermo.axis | 创建和修改绘图的函数 | ||
thermo.plot.new | 创建和修改绘图的函数 | ||
thermo.refs | 热力学数据校验功能 | ||
Ttr | 其他任务的功能 | ||
uniprot.aa | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
unitize | 其他任务的功能 | ||
usrfig | 创建和修改绘图的函数 | ||
util.array | 用于多维数组的函数 | ||
util.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
util.data | 热力学数据校验功能 | ||
util.expression | 表示化学式和性质的函数 | ||
util.fasta | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
util.formula | 使用化学公式的函数 | ||
util.legend | 用于生成图例文本的函数 | ||
util.list | 使用列表的函数 | ||
util.misc | 其他任务的功能 | ||
util.plot | 创建和修改绘图的函数 | ||
util.protein | 蛋白质功能(其他计算) | ||
util.seq | 使用序列数据的函数 | ||
util.test | 编写测试的函数 | ||
util.units | 转换单位的函数 | ||
util.water | 水和蒸汽性质函数 | ||
V_s_var | 水相状态参数的回归方程 | ||
water | 水的性质 | ||
water.AW90 | 水和蒸汽性质函数 | ||
water.DEW | 水的性质 | ||
water.IAPWS95 | 水的性质 | ||
water.lines | 创建和修改绘图的函数 | ||
water.SUPCRT92 | 水的性质 | ||
which.pmax | 使用列表的函数 | ||
WP02.auxiliary | 水和蒸汽性质函数 | ||
write.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
ZC | 使用化学公式的函数 | ||
ZC.col | 创建和修改绘图的函数 |