R语言CSESA包说明文档(版本 1.2.0)

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CSESA CSESA(基于CRISPR的肠道沙门氏菌血清型分析仪)。
FindSerotype 根据新间隔区的分析找到血清型。
GetAllNewSpacers 从分子序列及其逆补体中得到新的间隔子。
GetNewSpacer 从分子序列中得到新的间隔子。
GetNewSpacerCode 从分子序列中得到新的间隔区,并将其映射到代码中。
GetReverseComplement 返回序列的逆补码。
GetStr 从csesas3对象获取信息字符串。
PCR 通过这两个序列得到CSESA对象。
ReadInFile 读取三种类型的输入文件。
WGS 根据新间隔区的分析找到血清型。