| DLMtool-package | 数据有限方法工具箱 | ||
| AAVE | 性能度量方法 | ||
| AAVY | 性能度量方法 | ||
| addMPs | MSE对象的实用函数 | ||
| Albacore | 股票类对象 | ||
| applyMP | 对类数据对象应用管理过程 | ||
| Atlantic_mackerel | 数据类对象 | ||
| avail | 此类的哪些对象可用 | ||
| AvC | 平均捕获量 | ||
| AvC_MLL | 有大小限制的平均捕获量 | ||
| barplot.MSE | 绘制MSE结果的条形图 | ||
| BK | 贝丁顿和柯克伍德生活史 | ||
| BK_CC | 贝丁顿和柯克伍德生活史 | ||
| BK_ML | 贝丁顿和柯克伍德生活史 | ||
| Bluefin_tuna | 股票类对象 | ||
| Bluefin_tuna_WAtl | 股票类对象 | ||
| Blue_shark | 股票类对象 | ||
| boxplot.Data | TAC建议的箱线图 | ||
| Butterfish | 股票类对象 | ||
| CALsimp | 简化了数据对象的校准槽 | ||
| Can | 根据数据可用性确定管理程序（MPs） | ||
| Cant | 根据数据可用性确定管理程序（MPs） | ||
| CC | 基于年龄的捕获曲线 | ||
| CC1 | Geromont和Butterworth（2015）恒定捕获量 | ||
| CC2 | Geromont和Butterworth（2015）恒定捕获量 | ||
| CC3 | Geromont和Butterworth（2015）恒定捕获量 | ||
| CC4 | Geromont和Butterworth（2015）恒定捕获量 | ||
| CC5 | Geromont和Butterworth（2015）恒定捕获量 | ||
| cheatsheets | 打开DLMtool备忘单（需要internet连接） | ||
| checkMSE | MSE对象的实用函数 | ||
| China_rockfish | 数据类对象 | ||
| ChkObj | 检查DLM对象是否有效 | ||
| Choose | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
| ChooseEffort | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
| ChooseM | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
| ChooseSelect | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
| Cobia | 数据类对象 | ||
| compplot | 随机SRA方法模拟测试的通用比较图 | ||
| CompSRA | 年龄构成库存减少分析 | ||
| CompSRA4010 | 年龄构成库存减少分析 | ||
| condmet | 符合条件？ | ||
| Converge | 检查收敛性 | ||
| COSEWIC_Blow | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| COSEWIC_Dplot | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| COSEWIC_Hplot | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| COSEWIC_Pplot | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| COSEWIC_report | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| COSEWIC_tab | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| COSEWIC_tab_formatted | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| Cos_thresh_tab | COSEWIC满足的当前默认阈值 | ||
| cparscheck | runMSE的内部函数，用于检查OM slot cpars slot的格式是否正确 | ||
| Cplot | 绘制与上一历史年相对的生物量和产量中值 | ||
| CurC | Geromont和Butterworth（2015）恒定捕获量 | ||
| curE | 以当前努力水平捕鱼 | ||
| curE75 | 以当前努力水平捕鱼 | ||
| DAAC | 消耗校正平均渔获量 | ||
| Data-class | “数据”类 | ||
| Data-class-objects | 数据类对象 | ||
| Data2csv | 将数据对象转换为.csv数据文件 | ||
| DataDescription | 数据描述 | ||
| DataInit | 初始化数据输入文件 | ||
| Data_xl | 从Excel电子表格读入数据对象 | ||
| DBSRA | 基于损耗的库存减少分析 | ||
| DBSRA4010 | 基于损耗的库存减少分析 | ||
| DBSRA_40 | 基于损耗的库存减少分析 | ||
| DCAC | 消耗校正平均渔获量 | ||
| DCAC4010 | 消耗校正平均渔获量 | ||
| DCACs | 消耗校正平均渔获量 | ||
| DCAC_40 | 消耗校正平均渔获量 | ||
| DCAC_ML | 消耗校正平均渔获量 | ||
| DD | 延迟-差异库存评估 | ||
| DD4010 | 延迟-差异库存评估 | ||
| DDe | 基于努力的延迟-差异库存评估 | ||
| DDe75 | 基于努力的延迟-差异库存评估 | ||
| DDes | 基于努力的延迟-差异库存评估 | ||
| DecE_Dom | 舰队类对象 | ||
| DecE_HDom | 舰队类对象 | ||
| DecE_NDom | 舰队类对象 | ||
| DepF | FMSY/M比值法 | ||
| DFO_bar | 渔业及海洋部鱼类资源状况条形图 | ||
| DFO_hist | 渔业和海洋部 | ||
| DFO_plot | 渔政及海洋处 | ||
| DFO_plot2 | 渔业和海洋部默认地块2 | ||
| DFO_proj | 渔业和海洋部投影图 | ||
| DFO_quant | 渔业和海洋部生物量分位数图 | ||
| DFO_report | 创建标准DFO MSE报告 | ||
| DFO_spider | DFO性能蜘蛛图（前三个MPs） | ||
| DFO_tab | 创建标准DFO性能表 | ||
| DFO_tab_formatted | 标准DFO性能图的格式化版本，按阈值进行颜色编码 | ||
| DLMDataDir | 计算机上已安装程序包的目录 | ||
| DLMdiag | 根据数据可用性确定管理程序（MPs） | ||
| DLMenv | DLMenv空白环境 | ||
| DLMextra | 从DLMextra包加载更多数据 | ||
| DLMtool | 数据有限方法工具箱 | ||
| dnormal | 双正态选择性曲线 | ||
| Dom | 确定主生产计划 | ||
| DTe40 | 努力寻找一个固定的库存损耗目标 | ||
| DTe50 | 努力寻找一个固定的库存损耗目标 | ||
| DynF | 动态Fratio MP | ||
| EtargetLopt | 努力目标最佳长度 | ||
| Example_datafile | 数据类对象 | ||
| Fadapt | 自适应弗拉蒂奥 | ||
| Fdem | 人口统计学方法 | ||
| Fdem_CC | 人口统计学方法 | ||
| Fdem_ML | 人口统计学方法 | ||
| Fease | MP可行性诊断 | ||
| FlatE_Dom | 舰队类对象 | ||
| FlatE_HDom | 舰队类对象 | ||
| FlatE_NDom | 舰队类对象 | ||
| Fleet-class | “舰队”级 | ||
| Fleet-class-objects | 舰队类对象 | ||
| FleetDescription | 车队描述 | ||
| FMSYref | 参考管理程序 | ||
| FMSYref50 | 参考管理程序 | ||
| FMSYref75 | 参考管理程序 | ||
| Fratio | FMSY/M比值法 | ||
| Fratio4010 | FMSY/M比值法 | ||
| Fratio_CC | FMSY/M比值法 | ||
| Fratio_ML | FMSY/M比值法 | ||
| GB_CC | Geromont和Butterworth常数捕获控制规则 | ||
| GB_slope | Geromont和Butterworth指数坡度控制规则 | ||
| GB_target | 格洛蒙特和巴特沃斯瞄准了CPUE和catch MP | ||
| Gcontrol | G-控制MP | ||
| Generic_DecE | 舰队类对象 | ||
| Generic_FlatE | 舰队类对象 | ||
| Generic_Fleet | 舰队类对象 | ||
| Generic_IncE | 舰队类对象 | ||
| Generic_Obs | Obs类对象 | ||
| getclass | 获取对象类 | ||
| getmov2 | 优化功能，找到一个运动模型，匹配用户指定的运动特征修改为Rcpp。 | ||
| getsel | 计算选择性曲线 | ||
| Growth2OM | 根据年龄数据生成von Bertalanffy生长参数的自举估计 | ||
| Gulf_blue_tilefish | 数据类对象 | ||
| HDAAC | 消耗校正平均渔获量 | ||
| Herring | 股票类对象 | ||
| Hist-class | “历史”类 | ||
| hist2 | 直方图函数包装器 | ||
| ICI | 指数置信区间 | ||
| ICI2 | 指数置信区间 | ||
| Imp-class | “Imp”类 | ||
| Imp-class-objects | Imp类对象 | ||
| ImpDescription | IMP描述 | ||
| Imprecise_Biased | Obs类对象 | ||
| Imprecise_Unbiased | Obs类对象 | ||
| IncE_HDom | 舰队类对象 | ||
| IncE_NDom | 舰队类对象 | ||
| initialize | ~~函数“initialize”的方法~~ | ||
| initialize-method | ~~函数“initialize”的方法~~ | ||
| initialize-methods | ~~函数“initialize”的方法~~ | ||
| Input | 函数运行一组输入控制方法 | ||
| IOTC_plot | 印度洋金枪鱼委员会权衡图 | ||
| Iratio | 平均指数比 | ||
| Islope1 | 指数斜率跟踪 | ||
| Islope2 | 指数斜率跟踪 | ||
| Islope3 | 指数斜率跟踪 | ||
| Islope4 | 指数斜率跟踪 | ||
| IT10 | 迭代索引目标MP | ||
| IT5 | 迭代索引目标MP | ||
| Itarget1 | 增量索引目标MP | ||
| Itarget1_MPA | Itarget1和MPA | ||
| Itarget2 | 增量索引目标MP | ||
| Itarget3 | 增量索引目标MP | ||
| Itarget4 | 增量索引目标MP | ||
| ItargetE1 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
| ItargetE2 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
| ItargetE3 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
| ItargetE4 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
| ITe10 | 基于目标工作的索引 | ||
| ITe5 | 基于目标工作的索引 | ||
| ITM | 基于自然死亡率的指标 | ||
| joinData | 联接列表中的数据对象 | ||
| joinMSE | MSE对象的实用函数 | ||
| join_plots | 使用共享图例绘制多个绘图 | ||
| Kplot | 神户图：F/FMSY和B/BMSY的逐投影图 | ||
| L95target | 长度目标TAC MP | ||
| LBSPR | 基于长度的SPR MPs | ||
| LBSPR_MLL | 基于长度的SPR MPs | ||
| LH2OM | 预测缺失的生命史参数 | ||
| LHdatabase | LH数据库 | ||
| Low_Effort_Non_Target | 舰队类对象 | ||
| Lratio_BHI | Jardim等人2015年基于平均长度的指标MP | ||
| Lratio_BHI2 | Jardim等人2015年基于平均长度的指标MP | ||
| Lratio_BHI3 | Jardim等人2015年基于平均长度的指标MP | ||
| LSRA | 使用SRA估计R0，以匹配当前的F估计值，并避免因库存量小而受到惩罚 | ||
| LSRA2 | LSRA的另一个版本，它是filename_edges_strength的包装器，使用sapply返回正确类型的输出（模式） | ||
| LSRA_MCMC_sim | 内部SRA MCMC CPP代码 | ||
| LSRA_opt | LSRA和LSRA2函数的内估计函数 | ||
| LstepCC1 | 步进常数捕捉 | ||
| LstepCC2 | 步进常数捕捉 | ||
| LstepCC3 | 步进常数捕捉 | ||
| LstepCC4 | 步进常数捕捉 | ||
| LstepCE1 | 循序渐进的持续努力 | ||
| LstepCE2 | 循序渐进的持续努力 | ||
| Ltarget1 | 长度目标TAC MP | ||
| Ltarget2 | 长度目标TAC MP | ||
| Ltarget3 | 长度目标TAC MP | ||
| Ltarget4 | 长度目标TAC MP | ||
| LtargetE1 | 长度目标TAE MP | ||
| LtargetE4 | 长度目标TAE MP | ||
| LTY | 性能度量方法 | ||
| LW2OM | 根据数据估计长度-重量参数 | ||
| Mackerel | 股票类对象 | ||
| makeMeanMP | 创建一个平均多个主生产计划结果的主生产计划 | ||
| makePerf | 将OM对象转换为没有观察或处理错误的对象 | ||
| makeTransparent | 使颜色透明 | ||
| matlenlim | 尺寸限制管理程序 | ||
| matlenlim2 | 尺寸限制管理程序 | ||
| MCD | 平均捕获损耗 | ||
| MCD4010 | 平均捕获损耗 | ||
| minlenLopt1 | 尺寸限制管理程序 | ||
| ML2D | 渔获物平均长度的耗竭和F估计 | ||
| movfit_Rcpp | Rcpp版本的优化函数，返回用户指定和计算的移动参数之间的平方差。 | ||
| MPStats | 计算MP性能的统计信息 | ||
| MPtype | 管理程序类型 | ||
| MRnoreal | 空间封闭和分配管理程序 | ||
| MRreal | 空间封闭和分配管理程序 | ||
| MSE-class | “MSE”类 | ||
| MSEDescription | MSE描述 | ||
| Needed | 根据数据可用性确定管理程序（MPs） | ||
| NFref | 参考管理程序 | ||
| NOAA_plot | 国家海洋和大气管理局默认图1 | ||
| NOAA_plot2 | 通用交易图函数 | ||
| Obs-class | “Obs”类 | ||
| Obs-class-objects | Obs类对象 | ||
| ObsDescription | OBS描述 | ||
| OM-class | “OM”级 | ||
| OMDescription | OM描述 | ||
| OMdoc | 生成OM文档报告 | ||
| OMexample | 复制示例OM XL和OM文档 | ||
| OMinit | 初始化操作模型 | ||
| optCPU | 确定CPU的最佳数量 | ||
| ourReefFish | 数据类对象 | ||
| Overages | Imp类对象 | ||
| P10 | 性能度量方法 | ||
| P100 | 性能度量方法 | ||
| P50 | 性能度量方法 | ||
| Perfect_Imp | Imp类对象 | ||
| Perfect_Info | Obs类对象 | ||
| PerformanceMetric | 性能度量方法 | ||
| plot.Data | 打印数据对象 | ||
| plot.Fleet | 打印操作模型对象 | ||
| plot.Hist | 打印操作模型对象 | ||
| plot.Imp | 打印操作模型对象 | ||
| plot.MSE | 打印MSE对象 | ||
| plot.Obs | 打印操作模型对象 | ||
| plot.OM | 打印操作模型对象 | ||
| plot.pars | 打印操作模型对象 | ||
| plot.Stock | 打印操作模型对象 | ||
| plotFleet | 绘制舰队对象参数 | ||
| plotFun | 打印打印功能 | ||
| plotImp | 绘制实现对象参数 | ||
| plotM | 图M-年龄和尺寸 | ||
| plotMPA | 绘制历史空间闭合图 | ||
| plotObs | 绘制观测对象参数 | ||
| plotOFL | 供NOAA使用的通用OFL图 | ||
| plotOM | 绘制操作模型（OM）对象参数 | ||
| plotSelect | 绘制漏洞和保留曲线 | ||
| plotStock | 打印库存对象参数 | ||
| PMLimit | 创建性能限制和性能目标表 | ||
| PMObj | 创建性能限制和性能目标表 | ||
| PMobj-class | 用于存储数据以便使用数据限制方法进行分析的对象 | ||
| PNOF | 性能度量方法 | ||
| Porgy | 股票类对象 | ||
| Pplot | F/FMSY和B/BMSY的逐投影图 | ||
| Pplot2 | F/FMSY、B/BMSY、B/B0和产量的逐投影图 | ||
| Precise_Biased | Obs类对象 | ||
| Precise_Unbiased | Obs类对象 | ||
| predictLH | 预测缺失的生命史参数 | ||
| PWhisker | 性能晶须图 | ||
| Rcontrol | 内在增长率 | ||
| Rcontrol2 | 内在增长率 | ||
| RealFease | 基于真实数据的MP可行性诊断 | ||
| Rec-class | “Rec”级 | ||
| Red_snapper | 数据类对象 | ||
| Replace | 替换现有库存、车队、Obs或Imp对象 | ||
| replic8 | 放大（复制）DLM数据对象以创建用于模拟/灵敏度测试的附加维度 | ||
| Report | 生成数据报告 | ||
| ReqData | 需求数据 | ||
| Required | 什么管理程序需要什么数据 | ||
| Rockfish | 股票类对象 | ||
| runCOSEWIC | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
| runInMP | 对数据对象运行输入控件。 | ||
| runMP | 运行管理程序 | ||
| runMSE | 进行管理战略评估 | ||
| SBT1 | SBT简单MP | ||
| SBT2 | SBT简单MP | ||
| Sense | 敏感性分析 | ||
| setup | 设置并行处理 | ||
| show-method | 显示PM的输出 | ||
| show-method | 显示单个MP建议的输出 | ||
| simCAA | 模拟年龄数据 | ||
| simCAL | 模拟捕获长度数据 | ||
| SimulatedData | 模拟数据 | ||
| Simulation_1 | 数据类对象 | ||
| SketchFun | 手动绘制历史相对捕鱼努力轨迹。 | ||
| slotlim | 尺寸限制管理程序 | ||
| Snapper | 股票类对象 | ||
| Sole | 股票类对象 | ||
| SPmod | 基于剩余产量的渔获量限制修正值 | ||
| SPMSY | 捕获趋势剩余生产MSY MP | ||
| SPslope | 剩余产量的斜率 | ||
| SPSRA | 剩余生产库存减少分析 | ||
| SPSRA_ML | 剩余生产库存减少分析 | ||
| SRAcomp | 随机SRA方法的小区模拟试验 | ||
| SRAsim | 模拟年龄捕获和捕获历史数据以测试SRA方法 | ||
| StochasticSRA | 操作模型的随机SRA构造 | ||
| StochasticSRAcpp | 操作模型的随机SRA构造 | ||
| Stock-class | “股票”类 | ||
| Stock-class-objects | 股票类对象 | ||
| StockDescription | 股票描述 | ||
| STY | 性能度量方法 | ||
| Sub | 通过管理程序（MP）或模拟来子集MSE对象。 | ||
| SubCpars | OM cpars插槽的子集 | ||
| SubOM | OM对象中的库存、车队、Obs或Imp对象的子集 | ||
| summary-method | 数据对象摘要 | ||
| summary-method | MSE对象摘要 | ||
| TAC | 计算多个MP的TAC建议 | ||
| TACfilter | TAC滤波器 | ||
| Targeting_Small_Fish | 舰队类对象 | ||
| Target_All_Fish | 舰队类对象 | ||
| testOM | 测试OM | ||
| Thresh_tab | 满足DFO的当前默认阈值 | ||
| tinyErr | 消除观察、实施和过程错误 | ||
| tinyErr-method | 消除观察、实施和过程错误 | ||
| Toothfish | 股票类对象 | ||
| Tplot | 通用交易图函数 | ||
| Tplot2 | 通用交易图函数 | ||
| Tplot2_old | MSE对象的折衷图 | ||
| Tplot3 | 通用交易图函数 | ||
| Tplot_old | MSE对象的折衷图 | ||
| TradePlot | 通用交易图函数 | ||
| TradePlot_old | 一般折衷图 | ||
| Turing | 图灵试验 | ||
| updateMSE | MSE对象的实用函数 | ||
| userguide | 打开DLMtool用户指南 | ||
| Uses | 查找使用特定数据槽的管理过程 | ||
| validcpars | 有效的自定义参数（CPAR） | ||
| VOI | 计算信息价值 | ||
| VOI2 | 计算信息价值2 | ||
| VOIplot | 信息的另一个价值 | ||
| VOIplot2 | 利用PM函数求信息图的值 | ||
| wormplot | 生物质虫草 | ||
| writeCSV | 为对象编写csv的内部函数 | ||
| XL2Data | 从Excel文件导入数据对象 | ||
| XL2OM | 从Excel文件加载OM | ||
| Yield | 性能度量方法 | ||
| YPR | 每招募一人的产量分析，以获得FMSY代理F01 | ||
| YPR_CC | 每招募一人的产量分析，以获得FMSY代理F01 | ||
| YPR_ML | 每招募一人的产量分析，以获得FMSY代理F01 |