| add.cond.mean.many | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| add.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| add.cond.meanSq.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| add.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| add.joint.mean.many | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| add.joint.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| add.joint.meanSq.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| add.uncond.mean.one | ENplus，ENminus，Eholdtime，无条件结束状态。 | ||
| addhold.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| addhold.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| addhold.joint.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| addrem.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| addrem.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| addrem.joint.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| addremhold.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| all.cond.mean.PO | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| all.cond.mean2.PO | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| ARsim | 接受拒绝模拟 | ||
| BD.MCMC.SC | 线性生灭过程的MCMC | ||
| bdARsimCondEnd | 基于接受-拒绝的BD条件模拟 | ||
| bdARsimCondEnd.1 | 基于接受-拒绝的BD条件模拟 | ||
| BDloglikelihood.PO | 计算部分观测BD过程的对数似然 | ||
| BDloglikelihood.PO.CTMC_PO_1 | 计算部分观测BD过程的对数似然 | ||
| BDloglikelihood.PO.CTMC_PO_many | 计算部分观测BD过程的对数似然 | ||
| BDloglikelihood.PO.list | 计算部分观测BD过程的对数似然 | ||
| BDMC-class | “BDMC”类 | ||
| BDMC_many-class | 等级filename_points_covered_by_landmarks | ||
| BDPOloglikeGradSqr.CTMC_PO_many | 部分数据似然的梯度平方 | ||
| BDsummaryStats | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| BDsummaryStats-method | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| BDsummaryStats.PO | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| BDsummaryStats.PO-method | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| birth.death.simulant | 考虑移民的生灭过程模拟 | ||
| combineCTMC | 将几个CTMC合并成一个CTMC | ||
| CTMC-class | “CTMC”级 | ||
| CTMC.simulate | 从（“常规”）CTMC模拟 | ||
| CTMC.simulate.piecewise | 分段常数/齐次CTMC模拟 | ||
| CTMC2list | 连续时间马尔可夫链的两种表示之间的转换。 | ||
| CTMCPO2indepIntervals | 将filename_edges（或filename_landmarks或filename_points_covered_by_landmarks）转换为独立的间隔。 | ||
| CTMCPO2indepIntervals.CTMC_PO_1 | 将filename_edges（或filename_landmarks或filename_points_covered_by_landmarks）转换为独立的间隔。 | ||
| CTMCPO2indepIntervals.CTMC_PO_many | 将filename_edges（或filename_landmarks或filename_points_covered_by_landmarks）转换为独立的间隔。 | ||
| CTMC_PO_1-class | 等级filename_points_covered_by_landmarks | ||
| CTMC_PO_many-class | 等级filename_points_covered_by_landmarks | ||
| derivType | 从生成函数中获取方法的助手 | ||
| E.step.SC | 在部分观测生灭链上实现EM算法的相关函数 | ||
| EM.BD.SC | 线性生灭问题的期望最大化（有限制移民的filename_verticesfilename_edges） | ||
| EM.BD.SC.1 | 线性生灭问题的期望最大化（有限制移民的filename_verticesfilename_edges） | ||
| EM.BD.SC.cov.1sv | 具有协变量的线性生灭（及约束移民）问题的期望最大化 | ||
| f.i | 用于有条件地模拟链的第一跳的函数。 | ||
| genDoneSided | 数值微分 | ||
| getBDinform.full.SC.manual | 获取部分观测线性出生死亡（受限移民filename_edgesassume）MLE估计信息矩阵的助手 | ||
| getBDinform.lost.SC.manual | 获取部分观测线性出生死亡（受限移民filename_edgesassume）MLE估计信息矩阵的助手 | ||
| getBDinform.PO | 获取部分观测线性出生死亡的MLE估计的信息矩阵（filename_edgesfilename，受限移民） | ||
| getBDinform.PO.SC | 获取部分观测线性出生死亡的MLE估计的信息矩阵（filename_edgesfilename，受限移民） | ||
| getBDinform.PO.SC.manual | 获取部分观测线性出生死亡（受限移民filename_edgesassume）MLE估计信息矩阵的助手 | ||
| getBDjTimes | 获取BD进程的跳转时间。 | ||
| getBDMCsPOlist | “DOBAD”包中函数“getBDMCsPOlist”的方法 | ||
| getBDMCsPOlist-method | “DOBAD”包中函数“getBDMCsPOlist”的方法 | ||
| getBDMCsPOlist-methods | “DOBAD”包中函数“getBDMCsPOlist”的方法 | ||
| getBDsummaryExpecs | 通过EM算法计算推理所需产品期望的函数 | ||
| getBDsummaryProdExpecs | 通过EM算法计算推理所需产品期望的函数 | ||
| getDataSummary | 为给定的数据计算一些汇总信息 | ||
| getDataSummary.CTMC_PO_many | 为给定的数据计算一些汇总信息 | ||
| getInitParams | 获取EM的多个启动参数 | ||
| getIthJumpTime | 从CTMC获取跳转时间。 | ||
| getIthJumpTimes | 从CTMC获取跳转时间。 | ||
| getIthState | 从CTMC获取跳转时间。 | ||
| getMCstate | 获取CTMC在不同时间的状态 | ||
| getNewParams.SC | EM算法中约束模型中新参数的求解。 | ||
| getPartialData | 从一个完全观察到的链中得到“部分观察到的”链。 | ||
| getStates | 获取跳转状态列表。 | ||
| getStates-method | 获取跳转状态列表。 | ||
| getSubMC | 提取子马尔可夫链 | ||
| getT | 包'DOBAD'中getT函数的~~方法~~ | ||
| getT-method | 包'DOBAD'中getT函数的~~方法~~ | ||
| getT-methods | 包'DOBAD'中getT函数的~~方法~~ | ||
| getTimes | 获取跳转时间列表。 | ||
| getTimes-method | 获取跳转时间列表。 | ||
| getTs | 包'DOBAD'中函数getTs的~~方法~~ | ||
| getTs-method | 包'DOBAD'中函数getTs的~~方法~~ | ||
| getTs-methods | 包'DOBAD'中函数getTs的~~方法~~ | ||
| graph.CTMC | 绘制CTMC（可能部分观察到） | ||
| graph.CTMC.PO | 绘制CTMC（可能部分观察到） | ||
| hessianOneSided | 数值微分 | ||
| hold.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| hold.cond.meanSq.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| hold.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| hold.joint.meanSq.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| hold.uncond.mean.one | ENplus，ENminus，Eholdtime，无条件结束状态。 | ||
| holdTime | 计算BDMC和filename_landmarks的摘要统计信息 | ||
| list2CTMC | 将CTMC的列表表示形式转换为类版本 | ||
| M.step.SC | 在部分观测生灭链上实现EM算法的相关函数 | ||
| Nij | 计算完全观察到的CTMC中的跃迁。 | ||
| NijBD | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| NijBD.CTMC_many | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| Nminus | 计算BDMC和filename_landmarks的摘要统计信息 | ||
| Nminus.CTMC_PO_many | 计算BDMC和filename_landmarks的摘要统计信息 | ||
| Nplus | 计算BDMC和filename_landmarks的摘要统计信息 | ||
| Nplus.CTMC_PO_many | 计算BDMC和filename_landmarks的摘要统计信息 | ||
| num.deriv | 数值微分 | ||
| p.i | 用于有条件地模拟链的第一跳的函数。 | ||
| plot-method | 绘制CTMC | ||
| plot-methods | 绘制CTMC | ||
| power.coef.many | 获取幂级数的系数。。 | ||
| power.coef.one | 获取幂级数的系数。。 | ||
| process.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| process.prob.many | 计算线性生灭过程的转移概率。 | ||
| process.prob.one | 计算线性生灭过程的转移概率。 | ||
| rem.cond.mean.many | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| rem.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| rem.cond.meanSq.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| rem.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| rem.joint.mean.many | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| rem.joint.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| rem.joint.meanSq.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| rem.uncond.mean.one | ENplus，ENminus，Eholdtime，无条件结束状态。 | ||
| remhold.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| remhold.generator | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| remhold.joint.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| sampleJumpTime2 | 用于有条件地模拟链的第一跳的函数。 | ||
| sim.condBD | 模拟生灭过程，有条件地观察其在有限离散时间点的状态 | ||
| sim.condBD.1 | 模拟生灭过程，有条件地观察其在有限离散时间点的状态 | ||
| sim.condBD.main | 模拟生灭过程，有条件地观察其在有限离散时间点的状态 | ||
| sim.condBD.main.CTMC_PO_1 | 模拟生灭过程，有条件地观察其在有限离散时间点的状态 | ||
| sim.condBD.main.default | 模拟生灭过程，有条件地观察其在有限离散时间点的状态 | ||
| sim.condBD.main.list | 模拟生灭过程，有条件地观察其在有限离散时间点的状态 | ||
| simplify | 将列表转换为向量 | ||
| timeave.cond.mean.many | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| timeave.cond.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| timeave.joint.mean.many | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| timeave.joint.mean.one | 移民生灭过程的平均数和粒子时间平均数 | ||
| timeave.laplace | 具有移民的生灭过程的母函数 | ||
| waitTimes | 线性生灭过程EM算法的汇总统计 | ||
| [-method | “DOBAD”包中函数“$”的方法 | ||
| [-method | 订购CTMC | ||
| [[-method | “DOBAD”包中函数“$$”的方法 | ||
| [[-method | 订购CTMC |