R语言DSAIRM包 simulate_basicbacteria_modelexploration函数使用说明

返回R语言DSAIRM包函数列表


功能\作用概述:

此函数模拟一系列参数函数返回一个数据帧,其中包含已更改的参数和结果(请参阅详细信息)。


语法\用法:

simulate_basicbacteria_modelexploration(
B = 100,
I = 10,
g = 2,
Bmax = 1e+05,
dB = 1,
k = 1e-04,
r = 1e-04,
dI = 2,
tstart = 0,
tfinal = 300,
dt = 0.1,
samples = 10,
parmin = 2,
parmax = 10,
samplepar = "g",
pardist = "lin"
)


参数说明:

B : :细菌的起始值:数字

I : :免疫应答的起始值:数字

g : :细菌最大生长速率:数字

Bmax : :载菌量:数字

dB : :细菌死亡率:数字

k : :细菌杀灭率:数字

r : :免疫反应增长率:数字

dI : :免疫反应衰减率:数字

tstart : :模拟开始时间:数字

tfinal : :最终模拟时间:数字

dt : :返回结果的次数:数字

samples : :要在pmin和pmax之间运行的值的数目:数字

parmin : :可变参数的下限值:数字

parmax : :可变参数的上限值:数字

samplepar : :要更改的参数名称:字符

pardist : :参数值的间距,可以是“lin”或“log”:字符


示例\实例:

# To run the simulation with default parameters just call the function:
## Not run: res < - simulate_basicbacteria_modelexploration()
# To choose parameter values other than the standard one, specify them, like such:
res < - simulate_basicbacteria_modelexploration(samples=5, samplepar='dI', parmin=1, parmax=10)
# You should then use the simulation result returned from the function, like this:
plot(res$dat[,"xvals"],res$data[,"Bpeak"],xlab='Parameter values',ylab='Peak Bacteria',type='l')