R语言DSAIRM包 simulate_drugresistance_stochastic函数使用说明

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功能\作用概述:

随机模型的仿真部分:未感染的目标细胞(U),感染野生型/敏感和未治疗(Is),感染耐药(Ir),野生型病毒(Vs),耐药病毒(Vr)。


语法\用法:

simulate_drugresistance_stochastic(
U = 1e+05,
Is = 0,
Ir = 0,
Vs = 10,
Vr = 0,
b = 1e-05,
dI = 1,
e = 0,
m = 1e-04,
p = 100,
c = 4,
f = 0.1,
rngseed = 100,
tfinal = 100
)


参数说明:

U : :目标单元格的初始数目:数字

Is : :野生型感染细胞的初始数目:数字

Ir : :初始耐药感染细胞数:数字

Vs : :野生型病毒的初始数目:数字

Vr : :抗药性病毒的初始数目:数字

b : :细胞感染水平/感染率:数字

dI : :感染细胞死亡率:数字

e : :药物疗效:数字

m : :产生的抗性突变体分数:数字

p : :病毒产生率:数字

c : :病毒清除率:数字

f : :抵抗病毒的适应成本:数字

rngseed : :允许再现性的随机数生成器种子:数字

tfinal : :最大模拟时间:数字


示例\实例:

# To run the simulation with default parameters just call the function:
result < - simulate_drugresistance_stochastic()
# To choose parameter values other than the standard one, specify them, like such:
result < - simulate_drugresistance_stochastic(tfinal = 200, e = 0.5)
# You should then use the simulation result returned from the function, like this:
plot(result$ts[,"time"],result$ts[,"Vs"],xlab='Time',ylab='Uninfected cells',type='l')