返回R语言DSAIRM包函数列表

功能\作用概述:

此函数使用一组常微分方程运行车厢模型的模拟方程式模型描述了一个简单的病毒感染系统中存在的药物治疗用户提供的初始条件和参数值系统函数使用deSolve中的ODE解算器模拟ODE包裹。包裹功能返回包含每个变量和时间的时间序列的矩阵。

语法\用法：

simulate_modelcomparison_fit(
U = 1e+06,
I = 0,
V = 1,
X = 1,
dI = 1,
dV = 4,
p = 0.1,
g = 0,
k = 1e-06,
a = 1e-05,
alow = 1e-06,
ahigh = 1e-04,
b = 0.001,
blow = 1e-06,
bhigh = 0.01,
r = 0.1,
rlow = 0.01,
rhigh = 2,
dX = 1,
dXlow = 0.1,
dXhigh = 10,
fitmodel = 1,
iter = 10
)

参数说明：

U : ：未感染目标细胞的初始数目：数字

I : ：感染目标细胞的初始数目：数字

V : ：传染性病毒粒子的初始数目：数字

X : ：初始免疫反应水平：数字

dI : ：受感染细胞的死亡率：数字

dV : ：清除传染性病毒的速率：数字

p : ：受感染细胞产生病毒的速率：数字

g : ：单位换算系数：数字

k : ：T细胞（模型1）或Ab病毒（模型2）对受感染细胞的杀伤率：数字

a : ：T细胞活化（模型1）或抗体生长（模型2）：数值

alow : ：激活率下限：数字

ahigh : ：激活率上限：数字

b : ：病毒感染细胞的速率：数字

blow : ：感染率下限：数字

bhigh : ：感染率上限：数字

r : ：T细胞扩张率（模型1）：数值

rlow : ：膨胀率下限：数字

rhigh : ：膨胀率上限：数字

dX : ：抗体衰变速率（模型2）：数值

dXlow : ：衰减率下限：数字

dXhigh : ：衰减率上限：数字

fitmodel : ：配件型号1或2：数字

iter : ：优化器要执行的最大步骤数：数字

示例\实例：

# To run the code with default parameters just call the function:
## Not run: result < - simulate_modelcomparison_fit()
# To apply different settings, provide them to the simulator function, like such:
result < - simulate_modelcomparison_fit(iter = 5, fitmodel = 1)