R语言abdiv包说明文档（版本 0.2.0）

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alpha_diversities 实施多样性措施
berger_parker_d 伯格帕克优势
beta_diversities 实施多样性措施
binomial_deviance 二项式偏差与相异性指数
bray_curtis 布雷-柯蒂斯距离
bray_curtis_balanced 丰度数据的平衡变差和丰度梯度分量
bray_curtis_components 丰度数据的平衡变差和丰度梯度分量
bray_curtis_gradient 丰度数据的平衡变差和丰度梯度分量
brillouin_d 香农多样性及其对策
canberra 堪培拉及相关距离
chebyshev 切比雪夫距离
chord 欧氏距离及相关距离
clark_coefficient_of_divergence 堪培拉及相关距离
correlation_distance 相关和余弦距离
cosine_distance 相关和余弦距离
cy_dissimilarity 二项式偏差与相异性指数
diversity_measures 实施多样性措施
dominance 辛普森指数及其测量
euclidean 欧氏距离及相关距离
faith_pd 信仰的进化多样性
faith_tree Faith系统发育多样性的示例数据
generalized_unifrac UniFrac距离
geodesic_metric 欧氏距离及相关距离
hamming 汉明距离
heip_e 香农多样性及其对策
hellinger 欧氏距离及相关距离
horn_morisita Morisita指数和Horn-Morisita指数
information_unifrac UniFrac距离
invsimpson 辛普森指数及其测量
jaccard 存在/不存在数据的Beta多样性
jaccard_components 存在/不存在数据的嵌套和周转组件
jaccard_nestedness 存在/不存在数据的嵌套和周转组件
jaccard_turnover 存在/不存在数据的嵌套和周转组件
kempton_taylor_q 肯普顿泰勒Q指数
kulczynski_first 存在/不存在数据的Beta多样性
kulczynski_second 存在/不存在数据的Beta多样性
kullback_leibler_divergence Kullback-Leibler散度
leprieur_tree 系统发育嵌套和周转成分的示例数据
lozupone_panel_a UniFrac距离的示例数据
lozupone_panel_b UniFrac距离的示例数据
lozupone_tree UniFrac距离的示例数据
manhattan 曼哈顿及相关距离
margalef 马加里夫财富指数
match_to_tree 将计数向量与系统发育树相匹配
mcintosh_d 麦金托什优势指数D
mcintosh_e 麦金托什均匀度测度E
mean_character_difference 曼哈顿及相关距离
menhinick 梅尼尼克丰富度指数
minkowski 闵可夫斯基距离
modified_mean_character_difference 曼哈顿及相关距离
morisita Morisita指数和Horn-Morisita指数
phylogenetic_alpha_diversities 实施多样性措施
phylogenetic_beta_diversities 实施多样性措施
phylosor UniFrac距离
phylosor_nestedness 无权UniFrac距离的嵌套性和周转分量
phylosor_turnover 无权UniFrac距离的嵌套性和周转分量
pielou_e 香农多样性及其对策
richness 观察到的物种的丰富度或数量
rms_distance 欧氏距离及相关距离
rogers_tanimoto 存在/不存在数据的Beta多样性
russel_rao 存在/不存在数据的Beta多样性
ruzicka Ruzicka或加权Jaccard距离
ruzicka_balanced 丰度数据的平衡变差和丰度梯度分量
ruzicka_gradient 丰度数据的平衡变差和丰度梯度分量
shannon 香农多样性及其对策
simpson 辛普森指数及其测量
simpson_e 辛普森指数及其测量
sokal_michener 存在/不存在数据的Beta多样性
sokal_sneath 存在/不存在数据的Beta多样性
sorenson 存在/不存在数据的Beta多样性
sorenson_nestedness 存在/不存在数据的嵌套和周转组件
sorenson_turnover 存在/不存在数据的嵌套和周转组件
strong 斯特朗优势指数
unifrac UniFrac距离
unifrac_components 无权UniFrac距离的嵌套性和周转分量
unweighted_unifrac UniFrac距离
unweighted_unifrac_nestedness 无权UniFrac距离的嵌套性和周转分量
unweighted_unifrac_turnover 无权UniFrac距离的嵌套性和周转分量
variance_adjusted_unifrac UniFrac距离
weighted_kulczynski_second 加权Kulczynski距离
weighted_normalized_unifrac UniFrac距离
weighted_unifrac UniFrac距离
yule_dissimilarity 存在/不存在数据的Beta多样性