R语言ade4包说明文档(版本 1.7-16)

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ade4-package ade4包
abouheif.eg Abouheif的系统发育和数量性状
acacia 植物群落空间格局分析
acm.burt 多重对应分析
acm.disjonctif 多重对应分析
add.position.triangle 三角标绘
add.scatter 向现有绘图添加图形
add.scatter.eig 向现有绘图添加图形
ade4 ade4包
ade4-deprecated ade4中弃用的函数
aminoacyl 密码子用法
amova 分子方差分析
apis108 10个蜜蜂群体在8个微卫星位点的等位基因频率
apqe 二次熵的分配
aravo 阿拉沃高山植物分布(法国瓦卢瓦尔)
ardeche 具有双重(行和列)分区的表
area.plot 区域的图形显示
area.util.class 区域的图形显示
area.util.contour 区域的图形显示
area.util.xy 区域的图形显示
area2link 区域的图形显示
area2poly 区域的图形显示
arrival 到达重症监护室
as.data.frame.kdist 对象类“kdist”(K距离矩阵)
as.dudi 对偶图
as.krandboot 自举模拟
as.krandtest 置换测试的类别(在C中)。
as.krandxval 双重交叉验证
as.randboot 自举模拟
as.randtest 置换测试的类别(在C中)。
as.randxval 双重交叉验证
as.taxo 分类学
atlas 小生态数据集
atya 仙人掌的遗传变异
avijons 鸟类分布
avimedi 受约束序号的动物表
aviurba 生态表三元组
bacteria 43种细菌的基因组
banque 因子表
baran95 非洲河口鱼类
bca 类间分析
bca.coinertia 类间协整分析
bca.dpcoa 类间和类内双主坐标分析
bca.dudi 类间分析
bca.rlq 类间RLQ分析
bf88 立方生态数据
bicenter.wt 双加权定心
biplot.dudi 多元分析结果的图形表示法
bordeaux 品酒
boxplot.acm 多重对应分析
bsetal97 生态生物学特性
buech 布埃奇盆地
butterfly 遗传生态环境三重
bwca.dpcoa 类间和类内双主坐标分析
c.kdist 对象类“kdist”(K距离矩阵)
c.ktab 对象类“ktab”(K表)
cailliez 欧氏距离矩阵的变换
capitales 道路距离
carni19 食肉动物的系统发育和数量性状
carni70 食肉动物的系统发育和数量性状
carniherbi49 食肉动物和草食动物的分类、系统发育和数量性状
casitas 小家鼠的酶多态性
chatcat 定性加权变量
chats 一对变量
chazeb 夏洛来斑马
chevaine 银合欢的酶多态性
chickenk 肉鸡损失危险因素的兽医流行病学研究
clementines 水果生产
cnc2003 2003年经常光顾法国的电影院
coinertia 协整分析
col.names 对象类“ktab”(K表)
col.names.ktab 对象类“ktab”(K表)
col.names 对象类“ktab”(K表)
col.names 对象类“ktab”(K表)
coleo 模糊生物学性状表
combine.4thcorner 用于组合和调整输出的函数三表方法
combine.randtest.rlq 用于组合和调整输出的函数三表方法
corkdist 应用于“kdist”对象的距离随机化检验
corvus 球骨形态
costatis 统计与共惯性:一系列成对生态表的分析
costatis.randtest 成本统计分析的蒙特卡罗检验(C)。
covfacwt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
covwt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
dagnelie.test 达涅利多重正态性检验
deug 一些学生的考试分数
disc 饶氏相异系数
discrimin 线性判别分析(描述性统计)
discrimin.coa 判别对应分析
dist.binary 二进制数据距离矩阵的计算
dist.dudi 从统计三元组计算距离矩阵
dist.ktab 混合变量距离系数
dist.neig 邻接图距离矩阵的计算
dist.prop 百分比数据距离矩阵的计算
dist.quant 定量变量距离矩阵的计算
dist.taxo 分类学
divc Rao多样性系数又称二次熵
divcmax Rao多样性系数的最大值也称为二次熵
dotchart.phylog 系统发育树前面的许多数量变量的表示
dotcircle 圆上n值的表示
doubs 一对生态桌
dpcoa 双主坐标分析
dudi 对偶图
dudi.acm 多重对应分析
dudi.coa 对应分析
dudi.dec 分散对应分析
dudi.fca 模糊对应分析与模糊主成分分析
dudi.fpca 模糊对应分析与模糊主成分分析
dudi.hillsmith 混合数量变量和因素的表格排序
dudi.mix 混合数量变量和因素的表格排序
dudi.nsc 非对称对应分析
dudi.pca 主成分分析
dudi.pco 主坐标分析
dunedata 沙丘草地数据
ecg 心电图数据
ecomor 生态形态趋同
elec88 选举数据
enum.phylog 谱系发生
escopage 品酒K桌
euro123 三角形数据
fission 分裂模式与可遗传形态性状
foucart 同列同行K表对应分析
fourthcorner 计算第四个角点统计量的函数
fourthcorner.rlq 计算第四个角点统计量的函数
fourthcorner2 计算第四个角点统计量的函数
friday87 动物科K桌
fruits 一对桌子
gearymoran 空间和系统发育自相关的Moran's I和Geary'c随机化检验
ggtortoises 加拉帕戈斯陆龟种群的微卫星研究
granulo 粒度曲线
gridrowcol 完成常规网格分析
haar2level 一维数据的多级分解
hclust2phylog 创建系统发育
hdpg 人类群体的遗传变异
housetasks 列联表
humDNAm 人类线粒体DNA限制性数据
ichtyo 鱼类群落点样
inertia 多元方法中惯性(即贡献)的分解
inertia.dudi 多元方法中惯性(即贡献)的分解
irishdata Geary的爱尔兰数据
is.dudi 对偶图
is.euclid 距离矩阵是欧几里德矩阵吗?
is.ktab 对象类“ktab”(K表)
is.orthobasis 正交变换的正交基
julliot 种子散布
jv73 多区域K表
kcponds 自然保护区的池塘
kdist 对象类“kdist”(K距离矩阵)
kdist.cor 混合变量距离系数
kdist2ktab K距离矩阵(对象“kdist”)到K欧几里德表示(对象“ktab”)的变换
kdisteuclid 欧氏距离矩阵的一种求法
kplot K-表分析中多图的泛型函数
kplot.foucart Foucart对应分析的多重图
kplot.mcoa 多重共惯性分析的多重图
kplot.mfa 多重因子分析的多重图
kplot.pta 部分三元分析的多重图
kplot.sepan K-表中分离分析的多重图
kplot.statis 统计分析的多重图
kplotsepan.coa K-表中分离分析的多重图
kplotX.mdpcoa 多重双主坐标分析
krandtest 置换测试的类别(在C中)。
krandxval 双重交叉验证
ktab 对象类“ktab”(K表)
ktab.data.frame 从数据帧创建K表
ktab.list.df 从数据帧列表创建K表。
ktab.list.dudi 从对偶图列表创建K表
ktab.match2ktabs 统计与共惯性:一系列成对生态表的分析
ktab.util.addfactor 对象类“ktab”(K表)
ktab.util.names 对象类“ktab”(K表)
ktab.within 从内部分析到K表的过程
lascaux 遗传/环境和变量类型
ldist.ktab 混合变量距离系数
lingoes 距离矩阵的欧氏变换
lizards 蜥蜴的系统发育和数量性状
loocv 对“dudi”不做交叉验证
loocv.between 在“bca”的交叉验证中省略一个
loocv.discrimin 遗漏一个交叉验证用于“鉴别”分析
loocv.dudi 对“dudi”不做交叉验证
macaca 地标
macon 品酒
macroloire 卢瓦尔河大型无脊椎动物群(法国)
mafragh 植物生态调查
mantel.randtest Mantel检验(两个距离矩阵之间的相关性(在C中)
mantel.rtest Mantel检验(两个距离矩阵之间的相关性(单位:R))
mantelkdist 应用于“kdist”对象的距离随机化检验
maples 花的系统发育和数量性状
mariages 对应分析表
mbpcaiv 辅助变量多块主成分分析
mbpls 多块偏最小二乘法
mcoa 多重共惯性分析
mdpcoa 多重双主坐标分析
meanfacwt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
meau 生态数据:地点变量,地点物种,地点和时间
meaudret 生态数据:地点变量,地点物种,地点和时间
mfa 多因素分析
microsatt 牛品种间微卫星遗传关系的研究
mjrochet 远洋鱼类的系统发育和数量性状
mld 一维数据的多级分解
mollusc 动物群落与抽样试验
monde84 1984年世界形势
morphosport 运动员形态
mstree 最小生成树
multispati 多元空间分析
multispati.randtest 多元空间自相关检验(C)
multispati.rtest 多元空间自相关检验
nb2neig 邻域图
neig 邻域图
neig.util.GtoL 邻域图
neig.util.LtoG 邻域图
neig2mat 邻域图
neig2nb 邻域图
newick.eg Newick格式的系统发育树
newick2phylog 创建系统发育
newick2phylog.addtools 创建系统发育
niche 一对表的分析方法:环境和区系数据
niche.param 一对表的分析方法:环境和区系数据
nipals 非线性迭代偏最小二乘算法
njplot 细菌的系统发育与特性
olympic 奥林匹克十项全能
oribatid 甲螨
originality 物种的原创性
orthobasis 正交变换的正交基
orthobasis.circ 正交变换的正交基
orthobasis.haar 正交变换的正交基
orthobasis.line 正交变换的正交基
orthobasis.mat 正交变换的正交基
orthobasis.neig 正交变换的正交基
ours 定性变量表
p.adjust.4thcorner 用于组合和调整输出的函数三表方法
palm 亚马逊棕榈树的系统发育和数量性状
pap 食肉动物的分类和数量性状
pcaiv 关于工具变量的主成分分析
pcaivortho 正交工具变量的主成分分析
pcoscaled 主坐标简化分析
pcw 巴拿马运河沿线热带树木分布
perthi02 分子生物学中的分区列联表
phylog 系统发育
phylog.extract 系统发育
phylog.permut 系统发育
PI2newick 从系统发育独立软件包导入数据文件
piosphere 植物性状对放牧的响应
plot.4thcorner 计算第四个角点统计量的函数
plot.betcoi 类间分析
plot.betrlq 类间RLQ分析
plot.between 类间分析
plot.coinertia 协整分析
plot.corkdist 应用于“kdist”对象的距离随机化检验
plot.discrimin 线性判别分析(描述性统计)
plot.dpcoa 双主坐标分析
plot.foucart 同列同行K表对应分析
plot.krandtest 置换测试的类别(在C中)。
plot.mcoa 多重共惯性分析
plot.mfa 多因素分析
plot.multispati 多元空间分析
plot.niche 一对表的分析方法:环境和区系数据
plot.orthobasis 正交变换的正交基
plot.pcaiv 关于工具变量的主成分分析
plot.phylog 谱系发生
plot.procuste 两组点之间的简单Procruste旋转
plot.pta K-表的部分三元分析
plot.randtest 置换测试的类别(在C中)。
plot.rlq RLQ分析
plot.sepan K表中的分离分析
plot.statis STATIS,一种分析K表的方法
plot.witcoi 类内分析
plot.within 类内分析
plot.witrlq 类内RLQ分析
poly2area 区域的图形显示
predict.dudi 补充行的投影
prep.binary 混合变量距离系数
prep.circular 混合变量距离系数
prep.fuzzy 混合变量距离系数
prep.fuzzy.var 模糊对应分析与模糊主成分分析
prep.mdpcoa 多重双主坐标分析
presid2002 2002年法国总统选举结果
print.4thcorner 计算第四个角点统计量的函数
print.amova 分子方差分析
print.apqe 二次熵的分配
print.betcoi 类间分析
print.betdpcoa 类间和类内双主坐标分析
print.betrlq 类间RLQ分析
print.between 类间分析
print.coinertia 协整分析
print.corkdist 应用于“kdist”对象的距离随机化检验
print.discrimin 线性判别分析(描述性统计)
print.dpcoa 双主坐标分析
print.dudi 对偶图
print.foucart 同列同行K表对应分析
print.inertia 多元方法中惯性(即贡献)的分解
print.kdist 对象类“kdist”(K距离矩阵)
print.krandboot 自举模拟
print.krandtest 置换测试的类别(在C中)。
print.krandxval 双重交叉验证
print.ktab 对象类“ktab”(K表)
print.mcoa 多重共惯性分析
print.mfa 多因素分析
print.multiblock 显示和汇总多块对象
print.multispati 多元空间分析
print.neig 邻域图
print.niche 一对表的分析方法:环境和区系数据
print.nipals 非线性迭代偏最小二乘算法
print.orthobasis 正交变换的正交基
print.pcaiv 关于工具变量的主成分分析
print.phylog 系统发育
print.procuste 两组点之间的简单Procruste旋转
print.pta K-表的部分三元分析
print.randboot 自举模拟
print.randtest 置换测试的类别(在C中)。
print.randxval 双重交叉验证
print.rlq RLQ分析
print.sepan K表中的分离分析
print.statis STATIS,一种分析K表的方法
print.varipart 用2个解释表划分响应多元表的变异
print.witcoi 类内分析
print.witdpcoa 类间和类内双主坐标分析
print.within 类内分析
print.witrlq 类内RLQ分析
procella 鸟类系统发育与数量性状
procuste 两组点之间的简单Procruste旋转
procuste.randtest 普氏旋转奇异值之和的蒙特卡罗检验(C)。
procuste.rtest 普氏旋转奇异值之和的蒙特卡罗检验。
pta K-表的部分三元分析
quasieuclid 距离矩阵到欧氏距离矩阵的变换
radial.phylog 谱系发生
randboot 自举模拟
randboot.multiblock 多块方法的Bootstraped模拟
randtest 置换测试的类别(在C中)。
randtest.amova 分子方差分析中的排列检验。
randtest.between 组间惯性百分比的蒙特卡罗检验(C)。
randtest.betwit 类间和类内双主坐标分析
randtest.coinertia Co惯性分析的蒙特卡罗试验(C)。
randtest.discrimin 判别分析的蒙特卡罗检验(C)。
randtest.dpcoa 双主坐标分析的置换检验
randtest.pcaiv 解释(即约束)惯性百分比的蒙特卡罗检验
randtest.pcaivortho 解释(即约束)惯性百分比的蒙特卡罗检验
randtest.procuste 两组点之间的简单Procruste旋转
randtest.rlq RLQ分析
randxval 双重交叉验证
rankrock 排序表
reciprocal.coa 对应分析后的倒标度
reconst 从对偶图重构数据
reconst.coa 从对偶图重构数据
reconst.pca 从对偶图重构数据
redo.dudi 对偶图
rhizobium 地理隔离和寄主专化对两种固氮细菌遗传结构的影响
rhone 理化数据
rlq RLQ分析
row.names.ktab 对象类“ktab”(K表)
row.names 对象类“ktab”(K表)
rpjdl 鸟类和植被
rtest 排列测试的类别(在R中)。
rtest.between 组间惯性百分比(R)的蒙特卡罗检验。
rtest.discrimin 判别分析的蒙特卡罗检验(in R)。
rtest.niche 一对表的分析方法:环境和区系数据
RV.rtest 共惯性分析(in R)特征值和的蒙特卡罗检验。
RVdist.randtest 两个距离矩阵之间相关性的随机化检验。
RVkdist 应用于“kdist”对象的距离随机化检验
s.arrow 向量基投影的阶乘映射图
s.chull 等高线多边形阶乘映射的因子级作图
s.class 点类表示的阶乘映射图
s.corcircle 相关圆的阶乘映射图
s.distri 频率分布图
s.hist 散点图及其两个边缘直方图的显示
s.image 使用图像和轮廓的变量图
s.kde2d 核密度估计散点图
s.label 散点图
s.logo 用图片表示图形中的对象
s.match 成对坐标图
s.match.class 两组坐标的散点图和类划分
s.multinom 频率剖面图(例如在遗传学中很有用)
s.traject 轨迹图
s.value 图中值的表示
santacatalina 间接排序
sarcelles 夺回戒指的阵列
scalefacwt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
scalewt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
scatter 多元分析结果的图形表示法
scatter.acm 多重对应分析中的阶乘映射图
scatter.coa 对应分析的阶乘映射图
scatter.dudi 阶乘映射图
scatter.fca 模糊对应分析的阶乘映射图
scatter.nipals 非线性迭代偏最小二乘算法
scatter.pco 主坐标分析
scatterutil 图形实用程序函数
scatterutil.base 图形实用程序函数
scatterutil.chull 图形实用程序函数
scatterutil.convrot90 图形实用程序函数
scatterutil.eigen 图形实用程序函数
scatterutil.ellipse 图形实用程序函数
scatterutil.eti 图形实用程序函数
scatterutil.eti.circ 图形实用程序函数
scatterutil.grid 图形实用程序函数
scatterutil.legend.bw.square 图形实用程序函数
scatterutil.legend.square.grey 图形实用程序函数
scatterutil.legendgris 图形实用程序函数
scatterutil.logo 用图片表示图形中的对象
scatterutil.scaling 图形实用程序函数
scatterutil.sco 图形实用程序函数
scatterutil.star 图形实用程序函数
scatterutil.sub 图形实用程序函数
sco.boxplot 一个变量和一组定性变量之间联系的表示
sco.class 数字分数和带标签因子的1D图
sco.distri 数值分数上一组权重分布的均值-标准差表示
sco.gauss 一分与定性变量的关系
sco.label 带标签的数字分数的1D图
sco.match 带标签的一对数字分数的1D图
sco.quant 分析分数和数量变量之间关系的图表
score 一维图
score.acm 多重对应分析中研究一个因素的图
score.coa 对应分析后的倒标度
score.mix 混合分析中分析因子的图
score.pca 主成分分析中的因素分析图
scores.neig 邻域图
scoreutil.base 一维图
screeplot.dudi 多元分析结果的图形表示法
seconde 学生和科目
sepan K表中的分离分析
skulls 形态演化
statico 统计与共惯性:一系列成对生态表的分析
statico.krandtest 静态分析的蒙特卡罗测试(C)。
statis STATIS,一种分析K表的方法
steppe 植被样带
summary.4thcorner 计算第四个角点统计量的函数
summary.between 类间分析
summary.betwit 类间和类内双主坐标分析
summary.coinertia 协整分析
summary.corkdist 应用于“kdist”对象的距离随机化检验
summary.dist 距离矩阵是欧几里德矩阵吗?
summary.dpcoa 双主坐标分析
summary.dudi 对偶图
summary.inertia 多元方法中惯性(即贡献)的分解
summary.mcoa 多重共惯性分析
summary.mfa 多因素分析
summary.multiblock 显示和汇总多块对象
summary.multispati 多元空间分析
summary.neig 邻域图
summary.orthobasis 正交变换的正交基
summary.pcaiv 关于工具变量的主成分分析
summary.pcaivortho 正交工具变量的主成分分析
summary.rlq RLQ分析
summary.sepan K表中的分离分析
summary.within 类内分析
summary.witwit 内部对应分析
supcol 辅助柱的投影
supcol.coa 辅助柱的投影
supcol.dudi 辅助柱的投影
supdist PCO分析中附加项目的预测
suprow 补充行的投影
suprow.acm 补充行的投影
suprow.coa 补充行的投影
suprow.dudi 补充行的投影
suprow.fca 补充行的投影
suprow.mix 补充行的投影
suprow.pca 补充行的投影
suprow.pta K表部分三元分析的补充行投影
symbols.phylog 数量变量在系统发育树前面的表示
syndicats 对1000名受访者的样本提出了两个问题
t.dudi 对偶图
t.ktab 对象类“ktab”(K表)
t3012 法国30个城市的平均气温
tab.names 对象类“ktab”(K表)
tab.names.ktab 对象类“ktab”(K表)
tab.names 对象类“ktab”(K表)
tab.names 对象类“ktab”(K表)
table.cont 列联表图
table.dist 距离矩阵的图形显示
table.paint 阵列的灰度图
table.phylog 在系统发育树前绘制数组
table.prepare 阵列图
table.value 阵列图
tarentaise 山地鸟类
taxo.eg 分类学实例
taxo2phylog 创建系统发育
testdim 函数来执行维度测试
testdim.multiblock 用多重交叉验证法选择多块法的维数
testdim.pca 函数来执行维度测试
tintoodiel Tinto和Odiel河口地球化学
tithonia 花的系统发育和数量性状
tortues 彩绘龟的形态学研究
toxicity 齐次表
triangle.biplot 三角标绘
triangle.class 三角表示与点群
triangle.param 三角标绘
triangle.plot 三角标绘
triangle.posipoint 三角标绘
trichometeo 生态数据对
ungulates 有蹄类的系统发育和数量性状。
uniquewt.df 消除数组中的重复行
varfacwt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
variance.phylog 系统发育方差分析
varipart 用2个解释表划分响应多元表的变异
varwt 使用(加权)均值、方差和协方差(可能是因子的水平)计算或缩放数据
vegtf 特洛伊枫丹的植被
veuvage PCA中的定心示例
wca 类内分析
wca.coinertia 类内协整分析
wca.dpcoa 类间和类内双主坐标分析
wca.dudi 类内分析
wca.rlq 类内RLQ分析
westafrica 西非淡水鱼类动物地理学
withinpca 主成分分析中的标准化
witwit.coa 内部对应分析
witwitsepan 内部对应分析
woangers 安格尔城市(法国)林地中的植物组合
worksurv 法国工人调查(1970)
yanomama 距离矩阵
zealand 新西兰的道路距离
[.dudi 对偶图
[.kdist 对象类“kdist”(K距离矩阵)
[.krandtest 置换测试的类别(在C中)。
[.ktab 对象类“ktab”(K表)
[[.krandtest 置换测试的类别(在C中)。