| count_snps | 计算每个样本中存在/缺失位点的数量/比例 | ||
| d | 计算D、f4、f4比率或f3统计量。 | ||
| download_data | 下载示例SNP数据。 | ||
| eigenstrat | 特征数据构造器 | ||
| f3 | 计算D、f4、f4比率或f3统计量。 | ||
| f4 | 计算D、f4、f4比率或f3统计量。 | ||
| f4ratio | 计算D、f4、f4比率或f3统计量。 | ||
| filter_bed | 基于给定的BED文件过滤特征层数据 | ||
| keep_transitions | 删除横向（C->T和G->A替换） | ||
| loginfo | 将admixr包装的完整日志输出打印到控制台。 | ||
| merge_eigenstrat | 合并两组特征数据集 | ||
| print.admixr_result | 打印出admixr结果对象（dataframe或列表），而不显示隐藏的属性。 | ||
| print.EIGENSTRAT | 特征打印法 | ||
| qpAdm | 计算一组目标群体中的祖先比例。 | ||
| qpAdm_filter | 仅对“合理”模型过滤qpAdm旋转结果 | ||
| qpAdm_rotation | 根据Harney et al.2020（bioRxiv）中描述的轮换策略拟合qpAdm模型 | ||
| qpWave | 使用qpWave方法找到最可能的祖先波数。 | ||
| read_geno | 读取EIGENSTRAT ind/snp/geno文件。 | ||
| read_ind | 读取EIGENSTRAT ind/snp/geno文件。 | ||
| read_output | 从一个ADMIXTOOLS程序中读取输出文件。 | ||
| read_snp | 读取EIGENSTRAT ind/snp/geno文件。 | ||
| relabel | 更改总体或样本的标签 | ||
| reset | 重置对EIGENSTRAT对象的修改 | ||
| transversions_only | 删除横向（C->T和G->A替换） | ||
| write_geno | 写一个EIGENSTRAT ind/snp/geno文件。 | ||
| write_ind | 写一个EIGENSTRAT ind/snp/geno文件。 | ||
| write_snp | 写一个EIGENSTRAT ind/snp/geno文件。 |