R语言animaltracker包说明文档(版本 0.2.0)

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app_server 定义基于用户界面中的用户交互更新应用程序的逻辑
app_ui 定义“闪亮”应用程序的用户界面
boxplot_altitude 生成一个箱线图,通过GPS可视化高度分布。
boxplot_time_unit 生成一个箱线图,以可视化GPS测量单位之间的时间分布。
calc_bearing 用于清理Columbus P-1数据集的助手函数。给定以十进制度数表示的纬度坐标和长坐标,转换为弧度并计算方位角。
clean_batch_df 清除动物数据文件的目录
clean_export_files 清除所选目录中的所有动物GPS数据集(以.csv格式)。可以选择将干净的数据导出为电子表格、单个.rds数据文件或数据帧列表
clean_location_data 清理原始动物GPS数据集,执行标准化过程以删除不可能的值
clean_store_batch 清理动物数据文件的目录并以rds格式本地存储它们
compare_flags 连接并重新格式化两个动物数据帧,以便进行标记比较
compare_summarise_daily 比较两个动物数据集,并通过GPS计算每日汇总统计数据,日期、纬度、经度、航程、距离、速率、海拔列名应匹配。
compare_summarise_data 比较两个动物数据帧并计算汇总统计数据。GPS、date、lat、long、course、distance、rate、elevation列名称应匹配。
datePicker “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的日期选择器。
datePickerOutput animaltracker应用程序的日期选择器的“闪亮”模块UI输出。
deg_to_dec 用于清理Columbus P-1数据集的助手函数。给定纬度或长坐标的度数和方向,转换为十进制。
demo 演示来自奶牛的动物GPS数据
demo_comparison 两个动物数据集的演示比较
demo_filtered 从奶牛中筛选的动物GPS数据
demo_filtered_elev 从具有海拔高度的奶牛中筛选的演示动物GPS数据
demo_info 来自奶牛的原始演示动物GPS数据
demo_meta 奶牛GPS数据演示元数据
demo_unfiltered 来自奶牛的未过滤演示动物GPS数据
demo_unfiltered_elev 未经过滤的演示动物GPS数据来自海拔高度的奶牛
detect_peak_modz 根据Iglewicz和Hoaglin 1993,van Brakel 2014对鲁棒峰值检测算法的替代实现将修正z分数大于(A1)的数据点分类为异常值
dev_add_to_gitignore 将大文件添加到.git文件
get_data_from_meta 从指定的元数据获取动物数据集。如果日期范围无效,则自动返回i指定的所有动物数据。
get_file_meta 为动物数据文件目录生成元数据
get_meta 为动物数据帧生成元数据-文件名、站点、日期最小/最大、动物、最小/最大纬度/经度、存储位置
histogram_animal_elevation 生成模型高程-测量高度分布的直方图
histogram_time 生成直方图以可视化GPS测量之间的时间分布。
histogram_time_unit 生成直方图,以直观显示GPS测量单位之间的时间分布。
join_summaries 通过列连接两个动物数据框摘要并附加差异
line_compare 比较一段时间内两个数据集变量的移动平均值,按GPS分组,日期和列应匹配
lookup_elevation_aws 将公共AWS地形图的高程数据添加到动物gps数据的长/纬度坐标中
lookup_elevation_file 将地形图中的高程数据添加到动物gps数据的长/纬度坐标中
process_elevation 从现有动物数据文件处理和导出建模高程数据(可选)
qqplot_time 生成QQ图以显示GPS测量之间的时间分布。
quantile_time 确定大致对应于.05间隔分位数的GPS测量时间值差值。
reactivePicker “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的动态下拉选择。
reactivePickerOutput animaltracker应用程序动态下拉选择的“闪亮”模块UI输出。
reactivePlot “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的摘要统计表。
reactivePlotOutput animaltracker应用程序的绘图选项卡的“闪亮”模块UI输出。
reactiveRange “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的坐标范围输入。
reactiveRangeOutput animaltracker应用程序坐标范围输入的“闪亮”模块UI输出。
read_columbus 读取包含NMEA记录的Columbus P-1数据文件并将其处理到数据帧中
read_gps 读取位置文件名处未知格式的GPS数据集
read_zip_to_rasters 读取高度掩码文件的存档,并将第一个文件转换为光栅对象
run_shiny_animaltracker 你可以通过调用这个函数来运行animaltracker'shiny'应用程序。
run_validation_app 运行“闪亮”验证应用程序
save_meta 将元数据保存到数据帧并返回它
staticPicker “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的基本下拉选择。
staticPickerOutput animaltracker应用程序的基本下拉选择的闪亮模块UI输出。
stats “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的摘要统计表。
statsLabel “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的摘要统计标签。
statsLabelOutput animaltracker应用程序摘要统计标签的“闪亮”模块UI输出。
statsOutput animaltracker应用程序摘要统计表的“闪亮”模块UI输出。
store_batch_list 生成有关动物数据文件目录的基本元数据,并将这些文件作为数据帧存储为带有元数据的列表
summarise_anidf 计算动物数据帧的摘要统计信息
summarise_col 获取动物数据帧中单个列的摘要统计信息
summarise_unit 通过GPS单元总结了一些动物数据集
time “闪亮”模块服务器端UI生成器,用于animaltracker应用程序的时间输入。
timeOutput animaltracker应用程序时间输入的“闪亮”模块UI输出
violin_compare 将两个数据集的汇总统计数据作为并排曲线进行比较