| aphid-package | 用轮廓隐马尔可夫模型分析的aphid软件包。 | ||
| align | 多序列比对。 | ||
| align.AAbin | 多序列比对。 | ||
| align.default | 多序列比对。 | ||
| align.DNAbin | 多序列比对。 | ||
| align.list | 多序列比对。 | ||
| aphid | 用轮廓隐马尔可夫模型分析的aphid软件包。 | ||
| backward | 反向算法。 | ||
| backward.HMM | 反向算法。 | ||
| backward.PHMM | 反向算法。 | ||
| casino | 不诚实的赌场。 | ||
| deriveHMM | 从一组序列中导出一个标准的隐马尔可夫模型。 | ||
| derivePHMM | 从序列中导出一个轮廓隐马尔可夫模型。 | ||
| derivePHMM.AAbin | 从序列中导出一个轮廓隐马尔可夫模型。 | ||
| derivePHMM.default | 从序列中导出一个轮廓隐马尔可夫模型。 | ||
| derivePHMM.DNAbin | 从序列中导出一个轮廓隐马尔可夫模型。 | ||
| derivePHMM.list | 从序列中导出一个轮廓隐马尔可夫模型。 | ||
| forward | 前向算法。 | ||
| forward.HMM | 前向算法。 | ||
| forward.PHMM | 前向算法。 | ||
| generate | 从模型生成随机序列。 | ||
| generate.HMM | 从模型生成随机序列。 | ||
| generate.PHMM | 从模型生成随机序列。 | ||
| globins | 珠蛋白-蛋白质比对。 | ||
| logsum | 记录的概率之和。 | ||
| map | 优化配置文件结构。 | ||
| plot.HMM | 绘制标准隐马尔可夫模型。 | ||
| plot.PHMM | 图剖面隐马尔可夫模型。 | ||
| posterior | 后验译码。 | ||
| posterior.HMM | 后验译码。 | ||
| posterior.PHMM | 后验译码。 | ||
| 打印摘要方法。 | |||
| print.DPA | 打印摘要方法。 | ||
| print.HMM | 打印摘要方法。 | ||
| print.PHMM | 打印摘要方法。 | ||
| readPHMM | 将profile隐马尔可夫模型引入到R。 | ||
| substitution | 替代矩阵。 | ||
| train | 迭代模型优化。 | ||
| train.HMM | 迭代模型优化。 | ||
| train.PHMM | 迭代模型优化。 | ||
| unalign | 解构路线。 | ||
| Viterbi | 维特比算法。 | ||
| Viterbi.default | 维特比算法。 | ||
| Viterbi.HMM | 维特比算法。 | ||
| Viterbi.PHMM | 维特比算法。 | ||
| weight | 序列加权。 | ||
| weight.AAbin | 序列加权。 | ||
| weight.default | 序列加权。 | ||
| weight.dendrogram | 序列加权。 | ||
| weight.DNAbin | 序列加权。 | ||
| weight.list | 序列加权。 | ||
| writePHMM | 将配置文件隐马尔可夫模型导出为文本。 |