R语言aroma.core包说明文档（版本 3.2.1）

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aroma.core-package 包裹芳香.果核
AbstractCNData AbstractCNData类
AbstractPSCNData AbstractPSCNData类
aroma.core 包裹芳香.果核
AromaCellCpgFile 一个二进制文件，保存每个单元（探测/特征）的本地CpG密度
AromaCellPositionFile 保存每个细胞染色体/位置的二进制文件
AromaCellTabularBinaryFile AromaCellTabularBinaryFile类
AromaGenomeTextFile agenometextfile类
AromaMicroarrayDataFile 抽象raydatafile类
AromaMicroarrayDataSet AromamicRoaryDataSet类
AromaMicroarrayDataSetTuple raydatasetuple类
AromaMicroarrayTabularBinaryFile AromamicRoarraybarbinaryfile类
AromaPlatform 芳香平台类
AromaPlatformInterface AromaPlatformInterface类
AromaRepository 芳香沉积类
AromaTabularBinaryFile LarBinaryFile类
AromaTabularBinarySet LarBinarySet类
AromaTransform 芳香变换类
AromaUnitCallFile AromaUnitCallFile类
AromaUnitCallSet AromaUnitCallSet类
AromaUnitFracBCnBinaryFile AromaUnitFracBCnBinaryFile类
AromaUnitFracBCnBinarySet AromaUnitFracBCnBinarySet类
AromaUnitGenotypeCallFile aromaunitgenpecallfile类
AromaUnitGenotypeCallSet aromaunitgeneticecallset类
AromaUnitPscnBinaryFile AromaUnitPscnBinaryFile类
AromaUnitPscnBinarySet AromaUnitPscnBinarySet类
AromaUnitSignalBinaryFile AromaUnitSignalBinaryFile类
AromaUnitSignalBinarySet AromaUnitSignalBinarySet类
AromaUnitTabularBinaryFile AromaUnitTabularBinaryFile类
AromaUnitTotalCnBinaryFile AromaUnitTotalCnBinaryFile类
AromaUnitTotalCnBinarySet AromaUnitTotalCnBinarySet类
AromaUnitTypesFile AromaUnitTypesFile类
BinnedScatter BinnedScatter类
binnedSmoothing 矩阵逐列的分块平滑
binnedSmoothing.numeric 矩阵逐列的分块平滑
CbsModel CBS模型类
ChromosomalModel 染色体模型类
ChromosomeExplorer 染色体探索者类
colBinnedSmoothing 矩阵逐列的分块平滑
colBinnedSmoothing.matrix 矩阵逐列的分块平滑
colKernelSmoothing 矩阵逐列的核光滑化
colKernelSmoothing.matrix 矩阵逐列的核光滑化
CopyNumberChromosomalModel CopyNumberChromosomalModel类
CopyNumberSegmentationModel CopyNumberSegmentationModel类
doCBS 对数据集执行循环二进制分段（CBS）
doCBS.character 对数据集执行循环二进制分段（CBS）
doCBS.CopyNumberDataSet 对数据集执行循环二进制分段（CBS）
doCBS.CopyNumberDataSetTuple 对数据集执行循环二进制分段（CBS）
doCBS.default 对数据集执行循环二进制分段（CBS）
Explorer 资源管理器类
GladModel 模型班
HaarSegModel HaarSegModel类
kernelSmoothing 矩阵逐列的核光滑化
kernelSmoothing.numeric 矩阵逐列的核光滑化
NonPairedPSCNData 非成对pscndata类
PairedPSCNData PairedPSCNData类
ParametersInterface 参数接口类接口
RawAlleleBFractions rawbfractions类
RawCopyNumberModel RawCopyNumberModel类
RawCopyNumbers RawCopyNumbers类
RawGenomicSignals 信号类
RawMirroredAlleleBFractions rawmirroredalleleb类
RawSequenceReads RawSequenceReads类
SegmentedAlleleBFractions SegmentedAlleleBFractions类
SegmentedCopyNumbers SegmentedCopyNumbers类
SegmentedGenomicSignalsInterface SegmentedGenomicSignalsInterface类接口
UnitAnnotationDataFile UnitAnnotationDataFile接口类
UnitNamesFile UnitNamesFile接口类
UnitTypesFile UnitTypesFile接口类