R语言batchtools包说明文档(版本 0.9.14)

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batchtools-package 批处理工具:用于批处理系统计算的工具
addAlgorithm 定义实验算法
addExperiments 将实验添加到注册表
addJobTags 添加或删除作业标记
addProblem 为实验定义问题
ajoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
Algorithm 定义实验算法
assertRegistry 资产注册
batchExport 将对象导出到从属对象
batchMap 批处理系统的映射操作
batchMapResults 绘制结果图以创造新的就业机会
batchReduce 减少批处理系统的操作
batchtools 批处理工具:用于批处理系统计算的工具
binpack 连续执行的区块作业
btlapply 同步应用函数
btmapply 同步应用函数
cfBrewTemplate 编写工作描述文件的群集函数助手
cfHandleUnknownSubmitError 处理未知错误的群集函数助手
cfKillJob 用于终止批处理作业的群集函数助手
cfReadBrewTemplate 用于解析Brew模板的Cluster Functions Helper
chunk 连续执行的区块作业
clearRegistry 删除所有作业
ClusterFunctions ClusterFunctions构造函数
doJobCollection 执行JobCollection的作业
estimateRuntimes 估计剩余运行时
execJob 执行单个作业
Experiment 工作和实验
ExperimentRegistry 实验注册表构造函数
findDone 查找和筛选作业
findErrors 查找和筛选作业
findExperiments 查找和筛选作业
findExpired 查找和筛选作业
findJobs 查找和筛选作业
findNotDone 查找和筛选作业
findNotStarted 查找和筛选作业
findNotSubmitted 查找和筛选作业
findOnSystem 查找和筛选作业
findQueued 查找和筛选作业
findRunning 查找和筛选作业
findStarted 查找和筛选作业
findSubmitted 查找和筛选作业
findTagged 查找和筛选作业
flatten 展开嵌套数据帧
getDefaultRegistry 获取并设置默认注册表
getErrorMessages 检索错误消息
getJobNames 设置和检索作业名称
getJobPars 查询职务信息
getJobResources 查询职务信息
getJobStatus 查询职务信息
getJobTable 查询职务信息
getJobTags 查询职务信息
getLog 检查日志文件
getStatus 总结计算现状
getUsedJobTags 添加或删除作业标记
grepLogs 模式的Grep日志文件
Hook 自定义函数的触发器求值
Hooks 自定义函数的触发器求值
ijoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
Job 工作和实验
JobCollection JobCollection构造函数
JobNames 设置和检索作业名称
JoinTables 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
killJobs 杀死工作
ljoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
loadRegistry 从文件系统加载注册表
loadResult 加载单个作业的结果
lpt 连续执行的区块作业
makeClusterFunctions ClusterFunctions构造函数
makeClusterFunctionsDocker Docker的ClusterFunctions
makeClusterFunctionsInteractive 用于在正在运行的R会话中顺序执行的ClusterFunctions
makeClusterFunctionsLSF LSF系统的ClusterFunctions
makeClusterFunctionsMulticore 并行多核执行的聚类函数
makeClusterFunctionsOpenLava OpenLava的ClusterFunctions
makeClusterFunctionsSGE SGE系统的群集函数
makeClusterFunctionsSlurm Slurm系统的聚类函数
makeClusterFunctionsSocket 用于并行套接字执行的ClusterFunctions
makeClusterFunctionsSSH 用于远程SSH执行的ClusterFunctions
makeClusterFunctionsTORQUE OpenPBS/TORQUE系统的ClusterFunctions
makeExperimentRegistry 实验注册表构造函数
makeJob 工作和实验
makeJobCollection JobCollection构造函数
makeRegistry 注册表构造函数
makeSubmitJobResult 创建SubmitJobResult
ojoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
print.RuntimeEstimate 估计剩余运行时
Problem 为实验定义问题
reduceResults 减少结果
reduceResultsDataTable 对结果应用函数
reduceResultsList 对结果应用函数
Registry 注册表构造函数
removeAlgorithms 定义实验算法
removeExperiments 删除实验
removeJobTags 添加或删除作业标记
removeProblems 为实验定义问题
removeRegistry 从文件系统中删除注册表
resetJobs 重置作业的计算状态
rjoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
runHook 自定义函数的触发器求值
runOSCommand 在本地或远程计算机上运行操作系统命令
saveRegistry 将注册表存储到文件系统
setDefaultRegistry 获取并设置默认注册表
setJobNames 设置和检索作业名称
showLog 检查日志文件
sjoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
SubmitJobResult 创建SubmitJobResult
submitJobs 向批处理系统提交作业
summarizeExperiments 实验小结
sweepRegistry 检查一致性并删除过时信息
syncRegistry 同步注册表
Tags 添加或删除作业标记
testJob 以交互方式运行作业
ujoin 数据表的内部、左侧、右侧、外部、半连接和反连接
unwrap 展开嵌套数据帧
waitForJobs 等待作业终止
Worker 创建Linux工作进程