R语言biomod2包说明文档(版本 3.4.6)

返回R语言所有包列表

biomod2-package 集合预报框架下的物种分布模型
ANN_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
ANN_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
array-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
BinaryTransformation 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
BinaryTransformation, 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
BinaryTransformation-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
BIOMOD.EnsembleModeling.out filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.EnsembleModeling.out-class filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.formated.data filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.formated.data-class filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.formated.data-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.formated.data.PA filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.formated.data.PA-class filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.Model.Options-class filename_points_covered_by_landmarks输出对象类
BIOMOD.models.out-class filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.projection.out filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.projection.out-class filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
BIOMOD.stored.array BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.array-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.data BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.data-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.data.frame BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.data.frame-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.files BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.files-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.formated.data BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.formated.data-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.models.options BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.models.options-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.models.out BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.models.out-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.raster.stack BIOMOD.stored.xxx公司对象类
BIOMOD.stored.raster.stack-class BIOMOD.stored.xxx公司对象类
biomod2 集合预报框架下的物种分布模型
biomod2_ensemble_model biomod2模型对象类和函数
biomod2_ensemble_model-class biomod2模型对象类和函数
biomod2_model biomod2模型对象类和函数
biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
BIOMOD_ConvertOldRun 转换对象和输出BIOMOD.xx公司输入biomod2.xx对象和输出
BIOMOD_cv 自定义模型交叉验证过程
BIOMOD_EnsembleForecasting 物种在时空上的集合投影
BIOMOD_EnsembleModeling 创建和评估一组模型和预测
BIOMOD_FormatingData 初始化“biomod2”中使用的数据集
BIOMOD_LoadModels 在filename_points_covered_by_landmarks函数中构建的负载模型
BIOMOD_Modeling 运行一系列的物种分布模型
BIOMOD_ModelingOptions 为每个选定模型配置建模选项
BIOMOD_presenceonly 使用仅存在度量评估模型
BIOMOD_Projection 将“biomod2”中的校准模型投射到新的空间或时间
BIOMOD_RangeSize 范围大小变化分析
BIOMOD_RangeSize-method 范围大小变化分析
BIOMOD_RangeSize-methods 范围大小变化分析
BIOMOD_tuning 调整模型参数
calculate.stat 根据错误分类表计算评估指标
check_data_range biomod2模型对象类和函数
CTA_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
CTA_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
CustomIndexMaker 将默认包索引帮助文件替换为自定义文件。
data.frame-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
DF_to_ARRAY 转换biomod2数据框(或列表)到数组中
disk.pseudo.abs.selection biomod2内部功能
disk.pseudo.abs.selection-method biomod2内部功能
EMca_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
EMca_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
EMci_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
EMci_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
EMcv_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
EMcv_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
EMmean_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
EMmean_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
EMmedian_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
EMmedian_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
EMwmean_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
EMwmean_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
evaluate biomod2模型输出评估
FDA_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
FDA_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
FilteringTransformation 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
FilteringTransformation-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
FilteringTransformation-methods 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
Find.Optim.Stat 根据给定的评价方法计算出最佳得分
free BIOMOD.projection.out公司吸气剂
free-method BIOMOD.projection.out公司吸气剂
full_suffling 数据集洗牌工具
GAM_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
GAM_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
GBM_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
GBM_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
getEMalgos biomod2弃用函数
getEMalgos-method biomod2弃用函数
getEMbuiltModels biomod2弃用函数
getEMbuiltModels-method biomod2弃用函数
getEMeval biomod2弃用函数
getEMeval-method biomod2弃用函数
getEMkeptModels biomod2弃用函数
getEMkeptModels-method biomod2弃用函数
getEM_needed_models biomod2弃用函数
getEM_needed_models-method biomod2弃用函数
getFormalModel biomod2弃用函数
getFormalModel-method biomod2弃用函数
getModelsBuiltModels biomod2弃用函数
getModelsBuiltModels-method biomod2弃用函数
getModelsEvaluations biomod2弃用函数
getModelsEvaluations-method biomod2弃用函数
getModelsInputData biomod2弃用函数
getModelsInputData-method biomod2弃用函数
getModelsOptions biomod2弃用函数
getModelsOptions-method biomod2弃用函数
getModelsPrediction biomod2弃用函数
getModelsPrediction-method biomod2弃用函数
getModelsPredictionEval biomod2弃用函数
getModelsPredictionEval-method biomod2弃用函数
getModelsVarImport biomod2弃用函数
getModelsVarImport-method biomod2弃用函数
getProjection biomod2弃用函数
getProjection-method biomod2弃用函数
getScalingModel biomod2弃用函数
getScalingModel-method biomod2弃用函数
getStatOptimValue 得到评价统计指标的最优得分
get_built_models BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_built_models-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_calib_lines BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_calib_lines-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_evaluations BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_evaluations-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_formal_data BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_formal_data-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_formal_model biomod2模型对象类和函数
get_formal_model-method biomod2模型对象类和函数
get_kept_models BIOMOD.EnsembleModeling.out公司吸气剂
get_kept_models-method BIOMOD.EnsembleModeling.out公司吸气剂
get_needed_models BIOMOD.EnsembleModeling.out公司吸气剂
get_needed_models-method BIOMOD.EnsembleModeling.out公司吸气剂
get_options BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_options-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_predictions BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_predictions-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_projected_models BIOMOD.projection.out公司吸气剂
get_projected_models-method BIOMOD.projection.out公司吸气剂
get_scaling_model biomod2模型对象类和函数
get_scaling_model-method biomod2模型对象类和函数
get_variables_importance BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_variables_importance-method BIOMOD.models.out公司吸气剂
get_var_range biomod2模型对象类和函数
get_var_type biomod2模型对象类和函数
GLM_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
GLM_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
level.plot 绘制二维数据以可视化物种或环境的分布
LIST_to_ARRAY 转换biomod2数据框(或列表)到数组中
load_stored_object BIOMOD.存储对象功能
load_stored_object-method BIOMOD.存储对象功能
makeFormula 标准化配方制造商
MARS_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
MARS_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
matrix-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
MAXENT.Phillips.2_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
MAXENT.Phillips.2_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
MAXENT.Phillips_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
MAXENT.Phillips_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
models_scores_graph 生成模型评估二维图
multiple.plot 在BIOMOD中绘制并比较预测图
numeric-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
plot-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
plot-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
predict-method biomod2模型对象类和函数
Print_Default_ModelingOptions 获取BIOMOD内部模型选项的默认值
ProbDensFunc 概率密度函数
Projection biomod2内部功能
Projection-method biomod2内部功能
random.pseudo.abs.selection biomod2内部功能
random.pseudo.abs.selection-method biomod2内部功能
randomise_data 数据集洗牌工具
RasterBrick-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
RasterLayer-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
RasterStack-method 使用一个预先定义的阈值将物种的发生概率转换为二元存在-不存在数据
response.plot Biomod模型的响应曲线分析
response.plot2 用于绘制二维或三维物种分布模型预测响应的函数
RF_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
RF_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
sample.factor.levels 用于确保对阶乘变量的所有级别进行采样的工具
SampleMat2 样本二进制向量
show-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
show-method filename_points_covered_by_landmarks输出对象类
show-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
show-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
show-method filename_points_covered_by_landmarks()输出对象类
show-method biomod2模型对象类和函数
sre 表面范围包络线
sre.pseudo.abs.selection biomod2内部功能
sre.pseudo.abs.selection-method biomod2内部功能
SRE_biomod2_model biomod2模型对象类和函数
SRE_biomod2_model-class biomod2模型对象类和函数
update_objects 更新biomod2对象
user.defined.pseudo.abs.selection biomod2内部功能
user.defined.pseudo.abs.selection-method biomod2内部功能
variables_importance 变量重要性计算
.Models.prepare.data biomod2内部功能
.Models.prepare.data-method biomod2内部功能
.Projection.do.proj biomod2内部功能
.Projection.do.proj-method biomod2内部功能
.transform.outputs.array 重塑biomod2对象
.transform.outputs.list 重塑biomod2对象