bipartite-package | 二部生态网分析 | ||
addEmptyColToMatrix | 绘图模块Web | ||
addEmptyRowToMatrix | 绘图模块Web | ||
array2linkmx | 将webarray重塑为web X链接矩阵 | ||
as.one.mode | 网络矩阵的变换 | ||
as.tnet | 确保网络符合tnet标准 | ||
barrett1987 | 在加拿大北部的授粉网中捕获的个体。 | ||
BC | 归一化度、介数和贴近度中心性 | ||
betalinkr | 计算网络相异度(beta分集)及其分量 | ||
betalinkr_multi | 计算网络相异度(beta分集)及其分量 | ||
betweenness_w | 加权网络的介数中心性 | ||
bezerra2009 | 在巴西大草原的采油蜜蜂花访视网络中观察到的个体。 | ||
bipartite | 二部生态网分析 | ||
C.score | 计算矩阵中棋盘组合(C分数)的(标准化)平均数 | ||
CC | 归一化度、介数和贴近度中心性 | ||
closeness_w | 加权网络的贴近中心性 | ||
clustering_tm | 双模网络聚类系数的重新定义 | ||
compart | 检测隔室 | ||
computeModules | 计算模块 | ||
confint | 一些分析的例子 | ||
convert2moduleWeb | 函数filename_edges_strength和filename_points_covered_by_landmarks | ||
czvalues | 计算网络模块的c和z | ||
decimalr2dtable | 为非负十进制值生成具有相同边际总计的矩阵 | ||
degreedistr | 将函数拟合到网络中两个营养水平的累积度分布。 | ||
dfun | 计算二部网络中较低营养水平的每个物种的标准化专业化指数d'(d prime)。 | ||
DIRT_LPA_wb_plus | 函数filename_edges_strength和filename_points_covered_by_landmarks | ||
discrepancy | 计算矩阵的差异 | ||
distance_w | 加权网络中的距离 | ||
drawModules | 绘图模块Web | ||
elberling1999 | 北极高山瑞典授粉网访问次数 | ||
empty | 从矩阵中删除空行和空列。 | ||
endpoint | 计算二部网络的端点度 | ||
extinction | 模拟物种从二部网络中灭绝 | ||
fc | 计算web行的函数互补性 | ||
fd | 计算web行的函数互补性 | ||
frame2webs | 将观测表转换为网络矩阵 | ||
genweb | 生成一个随机的二部网络 | ||
getModuleCoordinates | 绘图模块Web | ||
grouplevel | 在网络的两个层次(组)的每个层次上分析二部网 | ||
H2fun | 二部网的专门化。 | ||
inouye1988 | 来自澳大利亚新南威尔士州雪山的授粉网络 | ||
intasymm | 一些分析的例子 | ||
intereven | 一些分析的例子 | ||
isCorrectModuleWebObject | 绘图模块Web | ||
junker2013 | 花卉参观网 | ||
kato1990 | 日本山毛榉林授粉网中捕获的个体数 | ||
kevan1970 | 加拿大埃尔斯米尔岛北部的授粉网络 | ||
linklevel | 二部网络的链路级指标 | ||
listModuleInformation | 列表模块信息 | ||
LPA_wb_plus | 函数filename_edges_strength和filename_points_covered_by_landmarks | ||
memmott1999 | 英国布里斯托尔附近草地上的花卉参观网 | ||
metaComputeModules | 计算模块 | ||
mgen | 根据给定的概率矩阵生成模拟网络 | ||
mlik | 一些分析的例子 | ||
module2constraints | 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF) | ||
moduleWeb-class | “moduleWeb”类 | ||
mosquin1967 | 加拿大西北地区梅尔维尔岛的花卉参观网络 | ||
motten1982 | 来自美国北卡罗来纳州的春季花卉参观网络 | ||
ND | 归一化度、介数和贴近度中心性 | ||
nest.smdm | 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF) | ||
nested | 计算嵌套性的任何一种度量 | ||
nestedcontribution | 计算每种对嵌套性的贡献(相对于空模型的z分数) | ||
nestedness | 计算存在/不存在矩阵的嵌套温度 | ||
nestedrank | 计算按最大嵌套度排序的矩阵中物种的秩 | ||
netstats | 一些分析的例子 | ||
networklevel | 二部网的全网层次分析 | ||
nodespec | 计算基于节点的专业化指数 | ||
NODF | 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF) | ||
NOS | 根据Strona& Veech(2015)计算节点重叠和分离 | ||
npartite | 计算屏蔽单模网络的索引 | ||
null.distr | 基于拟合边际分布的零模型 | ||
null.t.test | 比较观察到的模式和随机网。 | ||
nullmodel | 为网络分析生成空模型 | ||
olesen2002aigrettes | 亚速尔群岛的花卉探访网 | ||
olesen2002flores | 亚速尔群岛的另一个花卉探访网 | ||
olito2015 | 来自加拿大落基山脉的授粉网络 | ||
ollerton2003 | 奥利顿2003 | ||
one.grouplevel | 在网络的两个层次(组)的每个层次上分析二部网 | ||
PAC | 明显竞争的可能性 | ||
PDI | 配对差异指数 | ||
plot.wine | 加权交互嵌套估计 | ||
plotmat | 一些分析的例子 | ||
plotmatrix | 绘制按拓扑结构组织的矩阵 | ||
plotModuleWeb | 绘图模块Web | ||
plotPAC | 函数用于绘制圆形图以可视化潜在的明显竞争(PAC) | ||
plotweb | 可视化二部互动矩阵(例如食物网) | ||
plotweb2 | 可视化三方相互作用矩阵(例如三重营养食物网) | ||
prepareWebForPlottingModules | 绘图模块Web | ||
printoutModuleInformation | 打印输出模块信息 | ||
projecting_tm | 将二元加权双模网络投影到加权单模网络上。 | ||
quant2bin | 一些分析的例子 | ||
r2dexternal | 通过考虑外部丰度生成网络分析的空模型 | ||
readModuleData | 计算模块 | ||
robustness | 对物种灭绝的鲁棒性 | ||
Safariland | 阿根廷的授粉网 | ||
schemske1978 | 来自美国伊利诺伊州乌尔巴纳的花卉参观网络 | ||
second.extinct | 二部网络中的二次灭绝 | ||
shuffle.web | 洗牌web条目 | ||
slope.bipartite | 消光斜率模拟 | ||
small1976 | 加拿大渥太华泥炭沼泽的花卉参观网络 | ||
sortmatr | 一些分析的例子 | ||
sortmatrext | 一些分析的例子 | ||
sortmatrix | 按拓扑组织矩阵 | ||
sortweb | 函数对二部网站进行排序 | ||
specieslevel | 在物种水平上计算网络特性的各种指数 | ||
strength | 根据两种定义中的任何一种计算物种强度 | ||
swap.web | 为二部网络创建空模型 | ||
symmetrise_w | filename_points_covered_by_landmarks | ||
tnet_igraph | 将tnet网络导出到igraph对象 | ||
togetherness | 计算岛屿上物种的相同共存和共存数目 | ||
V.ratio | 按照Schluter(1984)的建议计算方差比 | ||
vazarr | 传粉网络。 | ||
vazcer | 传粉网络。 | ||
vazllao | 传粉网络。 | ||
vazmasc | 传粉网络。 | ||
vazmasnc | 传粉网络。 | ||
vaznull | 具有约束连通性和中等约束边际总量的零模型 | ||
vaznullexternal | 通过考虑外部丰度生成网络分析的空模型 | ||
vazquec | 传粉网络。 | ||
vazquenc | 传粉网络。 | ||
vazquez.example | 一些分析的例子 | ||
versionlog | 两部分版本和更改日志 | ||
visweb | 绘制函数来可视化二部食物网 | ||
web2edges | 将网络矩阵转换为(加权)边列表 | ||
webs2array | 将两个或多个站点放入一个站点数组中 | ||
wine | 加权交互嵌套估计 | ||
WNODA | 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF) | ||
WNODF | 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF) |