BridgeRCore | BRIC-seq数据计算RNA半衰期的BridgeR基本函数 | ||
BridgeRDatasetChecker | BRIC seq数据集检查器 | ||
BridgeRDataSetFromMatrix | 计算相对RPKM表达式数据表格式。 | ||
BridgeRDataSetFromRaw | 根据原始数据计算相对RPKM表达式。 | ||
BridgeReport | Shinyapp报告绘制RNA衰变曲线。 | ||
BridgeRGrubbsTest | RNA半衰期Grubbs试验。 | ||
BridgeRHalfLifeCalc3models | 用3模型法计算每个基因的RNA半衰期。 | ||
BridgeRHalfLifeCalcR2Select | 用R2选择法计算每个基因的RNA半衰期。 | ||
BridgeRNormalization | 计算BRIC-seq数据集的标准化RPKM。 | ||
BridgeRNormalizationFactors | 计算BRIC-seq数据集的标准化因子。 | ||
BridgeRNormalizationFactorsHK | 从家政基因计算标准化因子。 | ||
BridgeRPvalueEvaluation | 计算RNA半衰期和p值的倍数变化。 | ||
BridgeRResultChecker | BRIC seq结果检查器 | ||
CalcHalflifeDeviation | 计算RNA半衰期SD。 | ||
halflife_table | 用grubbs检验估计p值的BRIC-seq结果数据集 | ||
RNA_halflife_comparison | RNA半衰期比较的测试BRIC-seq数据集 | ||
RNA_halflife_comparison_HK | 使用看家基因测试BRIC-seq数据集进行RNA半衰期比较。 | ||
RNA_halflife_grubbs_test | 用grubbs检验检验用于p值估计的BRIC-seq数据集 |