R语言bridger2包说明文档(版本 0.1.0)

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BridgeRCore BRIC-seq数据计算RNA半衰期的BridgeR基本函数
BridgeRDatasetChecker BRIC seq数据集检查器
BridgeRDataSetFromMatrix 计算相对RPKM表达式数据表格式。
BridgeRDataSetFromRaw 根据原始数据计算相对RPKM表达式。
BridgeReport Shinyapp报告绘制RNA衰变曲线。
BridgeRGrubbsTest RNA半衰期Grubbs试验。
BridgeRHalfLifeCalc3models 用3模型法计算每个基因的RNA半衰期。
BridgeRHalfLifeCalcR2Select 用R2选择法计算每个基因的RNA半衰期。
BridgeRNormalization 计算BRIC-seq数据集的标准化RPKM。
BridgeRNormalizationFactors 计算BRIC-seq数据集的标准化因子。
BridgeRNormalizationFactorsHK 从家政基因计算标准化因子。
BridgeRPvalueEvaluation 计算RNA半衰期和p值的倍数变化。
BridgeRResultChecker BRIC seq结果检查器
CalcHalflifeDeviation 计算RNA半衰期SD。
halflife_table 用grubbs检验估计p值的BRIC-seq结果数据集
RNA_halflife_comparison RNA半衰期比较的测试BRIC-seq数据集
RNA_halflife_comparison_HK 使用看家基因测试BRIC-seq数据集进行RNA半衰期比较。
RNA_halflife_grubbs_test 用grubbs检验检验用于p值估计的BRIC-seq数据集