R语言cheddar包说明文档（版本 0.1-636）

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cheddar-package 生态群落分析与可视化
AggregateCommunities 聚合社区
AggregateCommunitiesBy 聚合社区
ApplyByClass 按类别申请
BasalNodes 节点连接性
Benguela 本格拉
Biomass 体重、数量丰度和生物量丰度
BodyMassBins 体重箱
BroadstoneStream 布罗德斯通河
Cannibals 同类节点
ChainAveragedTrophicLevel 营养级
CharacteristicPathLength 路径长度
cheddar 生态群落分析与可视化
ChesapeakeBay 切萨皮克
CollectionApply 集合应用
CollectionCPS 集合社区属性
CollectionNPS 集合节点属性
CollectionTLPS 集合营养链接属性
Community 社区
CommunityCollection 社区集合
CommunityPropertyNames 社区物业名称
ConnectedNodes 节点连接性
ConsumersByNode 节点的资源和使用者
ConsumersOfNodes 节点的资源和使用者
CP 单一社区属性
CPS 社区财产
CRMRatio 体重、数量丰度和生物量丰度
DefaultCategoryColours 绘图辅助对象
DefaultCategoryLabelColours 绘图辅助对象
DefaultCategorySymbols 绘图辅助对象
DefaultLinkColour 绘图辅助对象
Degree 节点度
DegreeDistribution 节点度分布
dim 社区
dim 社区集合
DirectedConnectance 营养链数
FlowBasedTrophicLevel 营养级
FormatLM 绘图辅助对象
FractionBasalNodes 节点连接性
FractionCannibalistic 同类节点
FractionConnectedNodes 节点连接性
FractionIntermediateNodes 节点连接性
FractionIsolatedNodes 节点连接性
FractionNonBasalNodes 节点连接性
FractionNonConnectedNodes 节点连接性
FractionNonTopLevelNodes 节点连接性
FractionOfNodesByClass 节点数
FractionOmnivorous 杂食的
FractionTopLevelNodes 节点连接性
HasM 社区有财产吗？
HasN 社区有财产吗？
HasTrophicLinks 社区有财产吗？
InDegree 节点度
IntermediateNodes 节点连接性
Intervality 食物网连通性
is.Community 社区
is.CommunityCollection 社区集合
IsBasalNode 节点连接性
IsCannibal 同类节点
IsConnectedNode 节点连接性
IsIntermediateNode 节点连接性
IsIsolatedNode 节点连接性
IsNonBasalNode 节点连接性
IsNonTopLevelNode 节点连接性
IsolatedNodes 节点连接性
IsOmnivore 杂食的
IsTopLevelNode 节点连接性
length 社区
length 社区集合
levels 社区
levels 社区集合
LinearRegressionByClass 按类别的线性回归
LinkageDensity 营养链数
LMabline 绘图辅助对象
LoadCollection 加载和保存CommunityCollection对象
LoadCommunity 加载和保存社区对象
Log10Biomass 体重、数量丰度和生物量丰度
Log10BLabel 绘图辅助对象
Log10CRMRatio 体重、数量丰度和生物量丰度
Log10M 体重、数量丰度和生物量丰度
Log10MLabel 绘图辅助对象
Log10MNBiomass 体重、数量丰度和生物量丰度
Log10N 体重、数量丰度和生物量丰度
Log10NLabel 绘图辅助对象
Log10RCMRatio 体重、数量丰度和生物量丰度
LongestTrophicLevel 营养级
LongWeightedTrophicLevel 营养级
LumpNodes 块节点
LumpTrophicSpecies 块状营养种
MeanMaximumTrophicSimilarity 营养相似性
Millstream 磨坊溪
MinimiseSumConsumerGaps 食物网连通性
MinimiseSumDietGaps 食物网连通性
names 社区
names 社区集合
NodeNameIndices 节点名称索引
NodePropertyNames 节点属性名称的向量
NodeQuantitativeDescriptors 定量描述符
NonBasalNodes 节点连接性
NonTopLevelNodes 节点连接性
NormalisedTrophicGenerality 节点度
NormalisedTrophicVulnerability 节点度
NP 单节点属性
NPS 节点属性
NumberOfConsumers 节点度
NumberOfNodes 节点数
NumberOfNodesByClass 节点数
NumberOfResources 节点度
NumberOfTrophicLinks 营养链数
NvMConvexHull NvMConvexHull公司
NvMIntercept 非线性回归
NvMInterceptByClass 非线性回归
NvMLinearRegressions 非线性回归
NvMSlope 非线性回归
NvMSlopeAndIntercept 非线性回归
NvMSlopeAndInterceptByClass 非线性回归
NvMSlopeByClass 非线性回归
NvMTriTrophicStatistics N对M三营养统计
NvMTriTrophicTable N对M三营养统计
Omnivores 杂食的
Omnivory 杂食的
OrderCollection 订购社区集合
OrderCommunity 建立社区
OutDegree 节点度
pHWebs 网站
PlaceMissingPoints 绘图辅助对象
plot.Community 社区
plot.CommunityCollection 社区集合
PlotAuppervAlower 绘制上下连杆角度
PlotBCvBR 绘制营养链接属性
PlotBDistribution 节点属性的图分布
PlotBPyramid 金字塔图
PlotBRvBC 绘制营养链接属性
PlotBSpectrum 光谱图
PlotBvM 打印节点属性
PlotBvRankB 节点属性的绘图秩
PlotCircularWeb 打印圆形web
PlotDegreeDistribution 节点属性的图分布
PlotLinearModels 绘图辅助对象
PlotMCvMR 绘制营养链接属性
PlotMDistribution 节点属性的图分布
PlotMRvMC 绘制营养链接属性
PlotMvB 打印节点属性
PlotMvN 打印节点属性
PlotMvRankM 节点属性的绘图秩
PlotNCvNR 绘制营养链接属性
PlotNDistribution 节点属性的图分布
PlotNPS 打印节点属性
PlotNPSDistribution 节点属性的图分布
PlotNPyramid 金字塔图
PlotNRvNC 绘制营养链接属性
PlotNSpectrum 光谱图
PlotNvM 打印节点属性
PlotNvRankN 节点属性的绘图秩
PlotPredationMatrix 绘制营养链接属性
PlotRankNPS 节点属性的绘图秩
PlotTLPS 绘制营养链接属性
PlotWagonWheel 绘图车车轮
PlotWebByLevel 按级别打印web
PredationMatrix 捕食矩阵
PredationMatrixToLinks 捕食矩阵与营养链
PreyAveragedTrophicLevel 营养级
print.Community 社区
print.CommunityCollection 社区集合
QuantitativeDescriptors 定量描述符
RCMRatio 体重、数量丰度和生物量丰度
RemoveCannibalisticLinks 移除同类相食的营养链
RemoveIsolatedNodes 删除孤立节点
RemoveNodes 删除节点
ResourceLargerThanConsumer 资源大于消费者
ResourcesAndConsumersByNode 节点的资源和使用者
ResourcesByNode 节点的资源和使用者
ResourcesOfNodes 节点的资源和使用者
SaveCollection 加载和保存CommunityCollection对象
SaveCommunity 加载和保存社区对象
ShortestPaths 路径长度
ShortestTrophicLevel 营养级
ShortWeightedTrophicLevel 营养级
SiteBySpeciesMatrix 按物种矩阵划分的群落采集点
SkipwithPond 鱼池
subset.CommunityCollection 社区集合的子集
SumBiomassByClass 按类别申请
SumConsumerGaps 食物网连通性
SumDietGaps 食物网连通性
summary.Community 社区
summary.CommunityCollection 社区集合
SumMByClass 按类别申请
SumNByClass 按类别申请
ThreeNodeChains 三节点链
TL84 星期二湖数据集
TL86 星期二湖数据集
TLP 单营养链性质
TLPS 营养链特性
TopLevelNodes 节点连接性
TrophicChains 营养链
TrophicChainsStats 营养链统计
TrophicGenerality 节点度
TrophicHeight 营养级
TrophicLevels 营养级
TrophicLinkPropertyNames 营养链接属性名称
TrophicLinksForNodes 节点的资源和使用者
TrophicSimilarity 营养相似性
TrophicSpecies 营养种
TrophicVulnerability 节点度
YthanEstuary 泰山河口
$ 社区
$ 社区集合
[.CommunityCollection 社区集合
[ 社区
[ 社区集合
[[ 社区
[[ 社区集合