| coexist-package | 物种共存建模与分析 | ||
| batch.coexistence | 共存汇总表批量分析 | ||
| batch.mcoexistence | 多个共存汇总表的批处理分析sta.M存在（）功能 | ||
| batch.monepar | 多物种模型下变参数多物种共存密度的批分析研究 | ||
| batch.mpaircomp | 批量分析探讨了不同场景下共存密度的一对参数，对于多物种情况下的建模 | ||
| batch.n2n | 两种群或多种群模型中生态位和中性/近中性的批量分析 | ||
| batch.onepar | 批量分析，探讨共存密度处理多个模型的情况下输出一个不同的参数，为2物种模型 | ||
| batch.paircomp | 批量分析，探讨共存密度处理不同的模式方案，两个重点参数，为2种模型 | ||
| batch.pdf.onepar | 批处理模式，用于绘制不同模型场景的矩阵热图图形，但仅处理一个参数（x轴）的采样点，并生成pdf图形 | ||
| batch.pdf.pairpar | 批量分析，绘制不同场景下成对参数矩阵的矩阵热图，并生成pdf图形 | ||
| batch.read | 根据顺序1、2、3、4、5、6批量读取不同的文件数据。。。在文件夹中 | ||
| coexist | 物种共存建模与分析 | ||
| comblist | 构造所有参数组合的完整列表 | ||
| comblist2 | 构造所有参数组合的完整列表 | ||
| competition | 在2种群模型中进行竞争分析 | ||
| compvar | 竞争参数矩阵 | ||
| convert.filenames | 将已保存数据集的名称转换为基于数字顺序的向量，该向量将由批处理读取（）功能 | ||
| dispersal | 对两种群模型的每个模拟时间步进行扩散分析 | ||
| dispvar | 扩散参数矩阵 | ||
| fast.flexsim | 更快的多物种模拟，但只是一点点，其实不快 | ||
| filename.check | 打开、检查并创建一个新文件夹（如果不存在） | ||
| flex.competition | 进行灵活的竞争分析，允许多个物种 | ||
| flex.dispersal | 执行特定物种的扩散和波动源分析，对于两个或多个物种模型，这是一个内部功能 | ||
| flexsim | 多物种模型的物种共存模拟（>=2） | ||
| make.heatmap | 根据矩阵值制作热图 | ||
| make.parcomb | 制作参数组合索引矩阵 | ||
| parsetting | 每个岛上每个物种的速率向量，被其他函数广泛调用 | ||
| plot_n2n | 绘制生态位和中性共存模式的分布并生成pdf图形 | ||
| read.data | 用参数组合索引文件读取数据 | ||
| read.patchdata | 从斑块中读取物种丰度数据，这是一项内部功能 | ||
| sim.coarse | 基于列出所有参数设置组合矩阵的两种群共存模型 | ||
| spabundance | 斑块/岛屿物种丰度的初始化 | ||
| sta.coexistence | 后验共存分析 | ||
| sta.comparison | 两种群模型单一情景的后验不同参数率比较 | ||
| sta.fitness | 两种群模型中性和生态位情况下的适合度/丰度比较 | ||
| sta.mcoexistence | 多物种模拟中单一场景的基本后验共存分析 | ||
| sta.mcomparison | 多物种模型单一情景下的后验不同参数率比较 | ||
| sta.mpaircomparison | 多参数空间下多种群的两两参数比较 | ||
| sta.paircomparison | 两种群模型的两两参数比较 |