cooccur-package | cooccur:R中物种共现的概率分析 | ||
beetles | 甲虫发生数据来自(Ulrich和Zalewski 2006)。 | ||
cooccur | 从社区数据集中计算成对共现模式的函数 | ||
create.N.matrix | 函数从潜在的spp x位点矩阵创建潜在共现位点(N)的spp x spp矩阵。 | ||
effect.sizes | 函数从类“cooccur”的对象中提取物种成对效应大小。 | ||
finches | 芬奇发生数据来自(Sanderson 2000)。 | ||
obs.v.exp | 函数用于绘制从存储在“cocurr”对象中的分析中观察到的oc出现与预期oc出现的可视化效果。 | ||
pair | 用于检查单个物种的共现模式的函数。 | ||
pair.attributes | 函数创建一个物种共现模式的总结。 | ||
pair.profile | 函数生成物种对共现模式的贡献的可视化。 | ||
plot.cooccur | 用于生成热图共生可视化的函数。 | ||
print.cooccur | 打印重要的成对物种结果。 | ||
prob.table | 函数从物种共现分析中提取概率表。 | ||
rodents | 啮齿动物发生数据来自(Brown和Kurzius 1987)。 | ||
summary.cooccur | 方法总结共现模式。 |