| ath.churchill | 拟南芥9种代谢物的代谢物表达数据示例。 | ||
| ath.gary | 拟南芥9种代谢物的代谢物表达数据示例。 | ||
| ath.metab | 来自拟南芥的24种代谢物的代谢物表达数据示例。 | ||
| ath.metabolites | 来自拟南芥的24种代谢物的代谢物表达数据示例。 | ||
| ath.result | 拟南芥代谢物表达数据5000次置换后QCLscan的输出。 | ||
| basic.qc | 创建质量控制图。 | ||
| CTL | 实验杂交中的CTL-CTL定位 | ||
| ctl | 实验杂交中的CTL-CTL定位 | ||
| ctl.circle | 多性状的圈图CTL | ||
| ctl.ctlmatrix | CTLhelper-用于CTL映射的助手函数 | ||
| ctl.dcormatrix | CTLhelper-用于CTL映射的助手函数 | ||
| ctl.lineplot | 多性状线性图CTL | ||
| ctl.load | 控制加载-加载D2.0版本计算的CTL | ||
| ctl.name | CTLhelper-用于CTL映射的助手函数 | ||
| ctl.names | CTLhelper-用于CTL映射的助手函数 | ||
| ctl.qtlmatrix | CTLhelper-用于CTL映射的助手函数 | ||
| ctl.qtlprofile | CTLhelper-用于CTL映射的助手函数 | ||
| CTLmapping | CTL图谱-扫描相关性状基因座（CTL） | ||
| CTLnetwork | CTLnetwork-来自多性状全基因组CTLscan的交互网络 | ||
| CTLprofiles | CTLprofiles-提取CTL交互配置文件 | ||
| CTLregions | CTL区域-通过全基因组CTL扫描获得所有重要的相互作用 | ||
| CTLscan | 相关性状基因座扫描 | ||
| CTLscan.cross | CTLscan.cross公司-相关性状位点（CTL）扫描（R/qtl交叉对象） | ||
| CTLsignificant | CTLsignificant-通过全基因组CTL扫描获得所有重要的相互作用 | ||
| detect.peaks | 检测峰值-峰值检测算法，用于将数据“展平”到某个阈值以上 | ||
| hist.CTLobject | CTL排列图直方图 | ||
| image.CTLobject | 在多个性状上绘制全基因组CTL | ||
| plot.CTLobject | 绘制CTL曲线或热图 | ||
| plot.CTLpermute | 微分相关与似然曲线 | ||
| plot.CTLscan | 将CTL结果绘制为条形图、直线图或GWAS图。 | ||
| plotTraits | plotTraits-性状与性状散点图，由选定的遗传位点着色 | ||
| print.CTLobject | 打印CTL基因组扫描结果 | ||
| print.CTLscan | 打印单个表型CTL扫描的结果 | ||
| qtlimage | 绘制CTLscan扫描表型的QTL热图 | ||
| QTLmapping | 用于CTL分析的QTLmapping-QTL作图方法 | ||
| scanSD | scanSD-分析两个性状基因型之间的标准差差异 | ||
| scanSD.cross | 扫描十字-分析两个性状在某一遗传标记上的标准差差异（R/qtl交叉对象） | ||
| scanSlopes | 扫描坡度-在两个特征之间创建坡度差异剖面 | ||
| scanSlopes.cross | 扫描坡度.cross-在两个性状（R/qtl交叉对象）之间创建斜率差异剖面 | ||
| yeast.brem | 来自酿酒酵母的301 RNA表达的基因表达数据示例。 |