agm | 自适应梯度匹配的主要功能 | ||
doMCMC | 主MCMC函数在指定的迭代次数内运行MCMC,并返回采样的参数值 | ||
getODEGradient | 从ODE系统计算梯度 | ||
LV_example_dataset | 具有2个物种和4个参数的Lotka-Volterra常微分方程系统的数据。种类依次为:1。绵羊(猎物)2。狼(食肉动物) | ||
proposeParamsMCMC | MCMC提案分发样本 | ||
sigmoidVarKernCompute | 为sigmoid内核计算K(x,x2),由gptk使用 | ||
sigmoidVarKernDiagCompute | 计算sigmoid内核的对角线(由gptk使用)。 | ||
sigmoidVarKernExpandParam | 在sigmoid内核中插入参数(由gptk使用) | ||
sigmoidVarKernExtractParam | sigmoid内核的辅助函数(由gptk使用) | ||
sigmoidVarKernGradient | 计算sigmoid核相对于每个参数的梯度(由gptk使用) | ||
sigmoidVarKernParamInit | sigmoid内核的辅助函数(由gptk使用) | ||
solveODE | 显式求解ODE系统。 |