R语言driveR包说明文档(版本 0.2.1)

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create_features_df 为驱动基因排序创建特征数据框架
create_gene_level_scna_df 创建基因级SCNA数据帧
create_noncoding_impact_score_df 创建非编码影响分数数据帧
create_SCNA_score_df 创建SCNA分数数据框
determine_double_hit_genes 确定双重命中基因
determine_hotspot_genes 确定热点基因
driveR 驱动程序:一个利用基因组学数据对癌症驱动基因进行优先排序的R程序包
example_cohort_features_table 驾驶员优先级排序的队列级特征表示例
example_cohort_scna_table 队列级体细胞拷贝数更改表示例
example_features_table 驱动程序优先级特征表示例
example_scna_table 副本号更改表示例
KEGG_cancer_pathways KEGG“癌症中的途径”-相关途径-基因集
KEGG_cancer_pathways_descriptions KEGG“癌症中的途径”-相关途径-描述
MCR_table 泛癌最小共同区域表
metapredictor_model 编码影响元预测的随机森林模型
MTL_submodel_descriptions MTL子模型描述
predict_coding_impact 创建编码影响元预测分数数据帧
prioritize_driver_genes 优先考虑癌症驱动基因
specific_thresholds 肿瘤类型特异性概率阈值
TCGA_MTL_fit 预测癌症驱动基因的多任务学习模型