create_features_df | 为驱动基因排序创建特征数据框架 | ||
create_gene_level_scna_df | 创建基因级SCNA数据帧 | ||
create_noncoding_impact_score_df | 创建非编码影响分数数据帧 | ||
create_SCNA_score_df | 创建SCNA分数数据框 | ||
determine_double_hit_genes | 确定双重命中基因 | ||
determine_hotspot_genes | 确定热点基因 | ||
driveR | 驱动程序:一个利用基因组学数据对癌症驱动基因进行优先排序的R程序包 | ||
example_cohort_features_table | 驾驶员优先级排序的队列级特征表示例 | ||
example_cohort_scna_table | 队列级体细胞拷贝数更改表示例 | ||
example_features_table | 驱动程序优先级特征表示例 | ||
example_scna_table | 副本号更改表示例 | ||
KEGG_cancer_pathways | KEGG“癌症中的途径”-相关途径-基因集 | ||
KEGG_cancer_pathways_descriptions | KEGG“癌症中的途径”-相关途径-描述 | ||
MCR_table | 泛癌最小共同区域表 | ||
metapredictor_model | 编码影响元预测的随机森林模型 | ||
MTL_submodel_descriptions | MTL子模型描述 | ||
predict_coding_impact | 创建编码影响元预测分数数据帧 | ||
prioritize_driver_genes | 优先考虑癌症驱动基因 | ||
specific_thresholds | 肿瘤类型特异性概率阈值 | ||
TCGA_MTL_fit | 预测癌症驱动基因的多任务学习模型 |